微管亲和调节激酶2与非小细胞肺癌DNA损伤应答及顺铂耐药相关

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌分类,主题为转录组学。源站描述显示,研究使用微阵列检测 MARK2 敲低相关的全局基因表达模式,涉及 3 株过表达 MARK2 的肺癌细胞系(H1993、H1693、H1650),每株在 shRNA 慢病毒转导后设 2 个生物学重复,并与空载体 p

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基因组分类Transcriptomics
Microtubule Affinity-Regulating Kinase 2 is associated with DNA damage response and cisplatin resistance in non-small cell lung cancer.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

微管亲和调节激酶2与非小细胞肺癌DNA损伤应答及顺铂耐药相关

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌分类,主题为转录组学。源站描述显示,研究使用微阵列检测 MARK2 敲低相关的全局基因表达模式,涉及 3 株过表达 MARK2 的肺癌细胞系(H1993、H1693、H1650),每株在 shRNA 慢病毒转导后设 2 个生物学重复,并与空载体 pLKO 对照比较。数据可用于分析 MARK2 与恶性表型、DNA 修复组分表达、NF-κB 抑制及细胞周期转录因子之间的关联,并探索非小细胞肺癌顺铂耐药的分子特征(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):MARK2 表达与肺癌细胞的恶性表型、DNA 修复组分表达、NF-κB 抑制及细胞周期转录因子相关。我们使用微阵列确定与 MARK2 敲低相关的全局基因表达模式。已选择 3 株过表达 MARK2 的肺癌细胞系,以评估 MARK2 敲低后的基因表达模式。在 shRNA 慢病毒转导后,对每株细胞系(H1993、H1693 和 H1650)的 2 个生物学重复进行 RNA 提取和 Affymetrix 微阵列杂交,并使用空载体 pLKO 与各自的对照进行比较。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-57966

下载信息

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MARK2表达与肺癌细胞中的恶性表型、DNA修复组分表达、NF-κB抑制及细胞周期转录因子相关。我们利用微芯片技术来确定与MARK2敲低相关的全局基因表达模式。选择了3个过表达MARK2的肺癌细胞系,以评估MARK2敲低后的基因表达模式。在shRNA慢病毒转导后,对每个细胞系(H1993、H1693和H1650)的两个生物学重复进行了RNA提取和在Affymetrix微芯片上的杂交,并与使用空载体pLKO的相应对照组进行了比较。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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