人I期非小细胞肺癌microRNA表达谱与复发关联研究
数据内容为采用锁定核酸微阵列检测77例I期非小细胞肺癌中752个microRNA的表达,旨在量化与手术切除后疾病复发相关的microRNA变化

基本信息
资源简介
人I期非小细胞肺癌microRNA表达谱与复发关联研究
该数据集聚焦于人类I期非小细胞肺癌的microRNA表达谱分析,旨在系统量化与手术切除后疾病复发相关的microRNA变化。数据集英文名称为“MicroRNA profiling of human stage I non-small cell lung cancer to quantify microRNA changes associated with disease recurrence”,属于肿瘤/肺癌领域,主题标签为Transcriptomics。其核心内容是通过锁定核酸微阵列技术,检测77例I期非小细胞肺癌样本中752个microRNA的表达水平,从而为探索microRNA与肺癌术后复发之间的关联提供转录组层面的数据支持。该数据集来源于omicsdi.org,适用于肺癌复发机制研究、microRNA生物标志物筛选及相关转录组分析等场景。
【数据集背景】
非小细胞肺癌是肺癌的主要亚型之一,I期患者通常接受手术切除治疗,但部分患者术后仍会出现疾病复发。识别与复发相关的分子变化,对于理解复发机制、优化术后监测和辅助治疗策略具有重要意义。microRNA作为一类重要的基因表达调控分子,在肿瘤发生、发展和复发过程中可能发挥关键作用。该数据集正是围绕这一背景,针对I期非小细胞肺癌患者,利用锁定核酸微阵列技术检测microRNA表达,以量化与手术切除后疾病复发相关的microRNA变化。数据集的主题标签为Transcriptomics,表明其属于转录组学范畴,关注的是RNA层面的表达信息。
【数据内容】
该数据集的核心数据为microRNA表达谱。具体而言,检测了752个microRNA在77例I期非小细胞肺癌中的表达情况。检测平台为锁定核酸微阵列。数据内容旨在量化与手术切除后疾病复发相关的microRNA变化,因此其表达数据可用于比较复发与非复发样本之间microRNA表达的差异。数据集英文名称明确指向“human stage I non-small cell lung cancer”和“disease recurrence”,说明样本类型和临床关注点均围绕I期非小细胞肺癌的复发问题。主题标签为Transcriptomics,进一步明确了数据所属的组学层次。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。根据源站描述,研究采用锁定核酸微阵列检测了77例I期非小细胞肺癌中752个microRNA的表达。样本例数为77例,均为I期非小细胞肺癌病例。检测平台为锁定核酸微阵列。研究目的是量化与手术切除后疾病复发相关的microRNA变化。除上述信息外,关于样本采集的具体时间、地点、机构、患者人口学特征、伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于以下研究方向:第一,探索I期非小细胞肺癌术后复发的microRNA相关机制;第二,筛选可能与疾病复发相关的microRNA候选标志物;第三,开展转录组层面的差异表达分析和功能富集分析;第四,作为肺癌microRNA表达谱的参考数据,用于与其他数据集进行比较或整合分析;第五,支持生物信息学方法开发与验证,例如分类模型构建、复发风险预测等。由于数据集明确针对I期非小细胞肺癌和术后复发,因此特别适合关注早期肺癌复发分子特征的研究。
【使用方法】
使用者可根据研究目的,对752个microRNA在77例样本中的表达数据进行统计分析。常见用法包括:比较复发组与非复发组之间microRNA的表达差异;计算差异表达microRNA的倍数变化和统计显著性;进行聚类分析、主成分分析或分类器构建;结合已知microRNA靶基因数据库进行通路和功能注释。由于数据基于锁定核酸微阵列平台,使用时应关注该平台特有的探针设计、杂交条件和信号归一化方式。具体的数据格式、预处理步骤、归一化方法、缺失值处理方式以及是否提供原始数据或处理后的表达矩阵,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的样本量为77例I期非小细胞肺癌,检测了752个microRNA,采用锁定核酸微阵列平台。这些信息表明数据集具有一定的规模,但关于样本的临床随访完整性、复发定义、复发时间、患者治疗细节、批次效应、技术重复、数据质量控制指标等,源站未提供。此外,数据集仅涵盖I期非小细胞肺癌,结论外推至其他分期或组织学亚型时需谨慎。由于源站未提供数据预处理和归一化的详细说明,使用者在分析前应自行评估数据质量并选择适当的处理流程。关于数据是否存在缺失值、离群样本或平台特异性偏差,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为omicsdi.org。关于数据集的引用方式、原始文献、作者列表、发表期刊、DOI、数据许可协议、使用限制以及是否允许商业用途等信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应直接访问omicsdi.org查询相关条目,以获取最新的引用和许可信息。在未获得明确许可信息前,建议仅将数据用于学术研究目的,并遵守来源站的相关规定。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-TABM-727
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
采用锁核酸微阵列检测了77例I期非小细胞肺癌中752种microRNA的表达,以量化与手术切除后疾病复发相关的microRNA变化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




