高危个体气道上皮的代谢重编程

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌领域,主题标签为 Proteomics。研究对肺癌不同风险等级个体的细胞学正常气道上皮细胞进行 shotgun 蛋白质组学分析,在支气管刷检样本中鉴定出 2869 个蛋白质,并通过通路分析发现高危个体中碳水化合物代谢通路富集

omicsdi
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蛋白质分类Proteomics
Metabolic reprogramming in the airway epithelium of high risk individuals

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

高危个体气道上皮的代谢重编程

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌领域,主题标签为 Proteomics。研究对肺癌不同风险等级个体的细胞学正常气道上皮细胞进行 shotgun 蛋白质组学分析,在支气管刷检样本中鉴定出 2869 个蛋白质,并通过通路分析发现高危个体中碳水化合物代谢通路富集。研究还利用平行反应监测质谱在独立样本中验证差异表达蛋白,并通过代谢通量分析揭示吸烟烟雾冷凝物处理的人支气管上皮细胞 BEAS2B 存在葡萄糖消耗和乳酸生成增加、合成能力增强及还原性羧化,提示 profound 代谢重编程(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们研究了通过 shotgun 蛋白质组学在来自不同肺癌风险等级个体的细胞学正常气道上皮细胞中鉴定出的蛋白质。我们在来自低、中或高肺癌风险个体的支气管刷检中鉴定出 2869 个蛋白质。通路分析显示高危个体中碳水化合物代谢通路富集。所选蛋白质的差异表达通过平行反应监测质谱在单独的个体支气管刷检中得到验证。用香烟烟雾冷凝物处理的人支气管上皮细胞 BEAS2B 中测得的葡萄糖消耗和乳酸生成增加,以及代谢通量分析揭示的合成能力增强和还原性羧化,表明存在 profound 代谢重编程。

【主题与分类】

主题标签:Proteomics。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000079331

下载信息

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数据说明

我们研究了通过鸟枪法蛋白质组学在不同肺癌风险个体的细胞学正常气道上皮细胞中鉴定出的蛋白质。我们在低、中、高风险肺癌个体的支气管刷检样本中鉴定出2869种蛋白质。通路分析显示,高风险个体中碳水化合物代谢通路富集。所选蛋白质的差异表达通过平行反应监测质谱法在另外的个体支气管刷检样本中得到了验证。经香烟烟雾冷凝物处理的人支气管上皮细胞BEAS2B中葡萄糖消耗和乳酸生成的增加,以及代谢通量分析揭示的合成能力增强和还原性羧化,表明存在深刻的代谢重编程。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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