LKB1 调控肺癌分化与转移

源站描述围绕 LKB1 在肺癌中的作用展开,指出 LKB1 的遗传性突变导致 Peutz-Jeghers 综合征,体细胞失活见于人肺腺癌;在 K-rasG12D 激活突变背景下,Lkb1 缺失会加速小鼠肺部肿瘤发生,表现为肿瘤潜伏期缩短、侵袭性增强并出现转移,还呈现鳞状、腺鳞状和大细胞等组织学类型

omicsdi
浏览 19
其他分类Transcriptomics
LKB1 modulates lung cancer differentiation and metastasis

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-06

资源简介

LKB1 调控肺癌分化与转移

该数据集来自 omicsdi.org,主题标签为 Transcriptomics,分类属于肿瘤 / 肺癌。源站描述围绕 LKB1 在肺癌中的作用展开,指出 LKB1 的遗传性突变导致 Peutz-Jeghers 综合征,体细胞失活见于人肺腺癌;在 K-rasG12D 激活突变背景下,Lkb1 缺失会加速小鼠肺部肿瘤发生,表现为肿瘤潜伏期缩短、侵袭性增强并出现转移,还呈现鳞状、腺鳞状和大细胞等组织学类型。该数据可用于研究 LKB1 与 K-ras 协同驱动肺癌分化与转移的机制(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):LKB1 的遗传性突变会导致 Peutz-Jeghers 综合征(PJS),其特征为肠道错构瘤以及胃肠道癌和乳腺癌发生频率轻度升高1。LKB1 的体细胞失活发生于人肺腺癌2-4,但其在该组织中的抑癌作用尚不清楚。在此我们表明,体细胞 Lkb1 缺陷与体细胞 K-rasG12D 激活突变强烈协同,加速小鼠肺肿瘤发生的发展。在 K-rasG12D 突变背景下(K-ras Lkb1L/L),Lkb1 缺陷与肿瘤潜伏期缩短和肿瘤侵袭性增加(包括转移)相关。此外,来自 K-ras Lkb1L/L 小鼠的肿瘤表现出单独或联合 K-rasG12D 突变、Ink4a/Arf 失活或 p53 失活时未见到的组织学类型——鳞状、腺鳞状和大细胞。体外实验提示 LKB1 su

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-6135

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-6135

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

LKB1的遗传性突变会导致Peutz-Jeghers综合征(PJS),其特征为肠道错构瘤及胃肠道和乳腺癌发病率轻度增加1。在人类肺腺癌中观察到LKB1的体细胞失活2-4,但其在该组织中的抑癌作用尚不清楚。本研究表明,体细胞Lkb1缺陷与体细胞K-rasG12D激活突变强烈协同,加速小鼠肺癌的发生。在K-rasG12D突变背景下(K-ras Lkb1L/L),Lkb1缺陷与肿瘤潜伏期缩短及包括转移在内的肿瘤侵袭性增强相关。此外,K-ras Lkb1L/L小鼠的肿瘤展现出鳞状、腺鳞状和大细胞组织学类型,这些类型在单独或联合发生K-rasG12D突变、Ink4a/Arf失活或p53失活时未见。体外实验表明,LKB1通过依赖和不依赖p16INK4a-ARF-p53的机制抑制肺癌的发生和进展。这些数据表明,LKB1调控肺癌的进展和分化。

关键词:癌症研究 为了分析LKB1在肺癌进展和分化中的作用,我们从有/无lkb1缺失的小鼠中解剖肺部肿瘤,并进行了微阵列分析以比较它们的基因表达模式。此外,我们还在A549和H2126细胞系中,在重建野生型lkb1(wt-lkb1)或lkb1的激酶死亡形式(lkb1-KD)后,进行了微阵列分析,以验证我们在体内研究中观察到的结果。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。