整合分析 microRNA、mRNA 与 DNA 拷贝数数据揭示非小细胞肺癌中石棉相关变化
研究整合 miRNA 表达谱与同一患者材料先前获得的 aCGH 和 mRNA 表达微阵列数据，以识别新的石棉相关分子关联
基本信息
资源简介
整合分析 microRNA、mRNA 与 DNA 拷贝数数据揭示非小细胞肺癌中石棉相关变化
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/肺癌领域，主题标签为 Transcriptomics。研究整合 miRNA 表达谱与同一患者材料先前获得的 aCGH 和 mRNA 表达微阵列数据，以识别新的石棉相关分子关联。结果发现 12 个新的石棉相关 miRNA，其中 miR-148b、miR-374a、miR-24-1*、Let-7d、Let-7e、miR-199b-5p、miR-331-3p 过表达，miR-939、miR-671-5p、miR-605、miR-1224-5p、miR-202 低表达，并与 GADD45A、LTBP1、FOSB、NCALD、CACNA2D2、MTSS1、EPB41L3 等靶基因呈负相关。该数据。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：背景：肺癌在全球所有癌症中死亡率最高，而石棉相关肺癌是主要的职业性癌症之一。多年来，识别石棉相关分子变化一直是主要研究热点。本研究的目的是通过将 miRNA 表达谱与同一患者材料先前获得的微阵列数据（aCGH 和 mRNA 表达）整合，来识别新的石棉相关分子关联。结果：识别出 12 个新的石棉相关 miRNA（过表达：miR-148b、miR-374a、miR-24-1*、Let-7d、Let-7e、miR-199b-5p、miR-331-3p；低表达：miR-939、miR-671-5p、miR-605、miR-1224-5p、miR-202），它们与靶基因（如 GADD45A、LTBP1、FOSB、NCALD、CACNA2D2、MTSS1、EPB41L3）呈负相关。此外，若干已知和新的肺癌相关
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-25508
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源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-25508
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景：肺癌在全球所有癌症中死亡率最高，而与石棉相关的肺癌是主要的职业性癌症之一。多年来，识别与石棉相关的分子变化一直是研究的热点。本研究旨在通过将miRNA表达谱与先前从同一患者材料中获得的微阵列数据（aCGH和mRNA表达）相结合，识别新的与石棉相关的分子关联。结果：识别出12个新的与石棉相关的miRNA（过表达：miR-148b、miR-374a、miR-24-1*、Let-7d、Let-7e、miR-199b-5p、miR-331-3p；低表达：miR-939、miR-671-5p、miR-605、miR-1224-5p、miR-202），它们与靶基因（如GADD45A、LTBP1、FOSB、NCALD、CACNA2D2、MTSS1、EPB41L3）呈负相关。此外，还识别出几个已知的和新的与肺癌相关的miRNA。DNA拷贝数改变也与肺癌中四个miRNA的失调相关。
综合分析的重要性通过一个有趣的发现得到了凸显：众所周知的鳞状细胞癌相关miR-205的过表达与基因DOK4的下调相关联。结论：我们鉴定出了与肺癌病因学和组织学相关的新型失调miRNAs及靶基因的负相关表达。此外，DNA拷贝数改变与部分miRNAs的失调相关。本研究的结果可能具有潜在的诊断意义，但需要进一步研究。方法：本研究所使用的患者材料包括来自高度石棉暴露（13份样本）和非暴露（13份样本）患者的26份肿瘤及正常肺组织。对照肺组织样本取自7名无癌症患者以及商业来源的肺组织RNA。miRNA表达的数据分析以及miRNA与mRNA数据的整合分析使用了
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