IDR idr0082-pennycuick-lesions 实验A 肺癌病变影像数据集

主题标签:肿瘤、肺癌、IDR、细胞成像、组织成像、病变。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。本数据集为肿瘤领域的图像公开数据集,来源:idr,主题涵盖肿瘤。

idr
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图像图像分割肿瘤肺癌IDR细胞成像组织成像病变
IDR idr0082-pennycuick-lesions (experimentA)

基本信息

模态
图像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

IDR idr0082-pennycuick-lesions 实验A 肺癌病变影像数据集

IDR idr0082-pennycuick-lesions (experimentA) 是一个聚焦肿瘤领域的公开细胞与组织成像数据集,主题标签涵盖肿瘤、肺癌、IDR、细胞成像、组织成像与病变。该数据集来源于 Image Data Resource(IDR),属于经策展的细胞/组织成像研究资源,底层采用 OME 标准并由 EMBL-EBI 参与维护。数据集英文全称为 IDR idr0082-pennycuick-lesions,实验编号为 experimentA,包含 3 幅图像。整体而言,该数据集面向肺癌相关病变的成像研究,适合作为肿瘤影像分析、细胞与组织形态观察以及相关算法验证的公开数据来源,为研究人员提供可访问、可复用的成像资料。

【数据集背景】

该数据集属于肿瘤研究领域,具体分类为肺癌。其主题围绕病变展开,结合细胞成像与组织成像两类观察尺度,旨在支持对肿瘤相关病变的成像研究。作为 IDR 平台上的策展研究之一,它依托 OME/EMBL-EBI 的成像数据资源体系,面向公开科研社区提供访问。IDR 本身是面向细胞与组织成像的策展型数据资源,强调图像数据的规范化组织与长期可用性,因此该数据集在来源上具备资源平台层面的可信背景。关于该研究的具体科学问题、实验设计动机与立项背景,源站未提供。

【数据内容】

该数据集包含 3 幅图像,实验标识为 experimentA。数据主题标签包括肿瘤、肺癌、IDR、细胞成像、组织成像与病变,表明图像内容涉及细胞与组织层面的病变观察。数据集英文名为 IDR idr0082-pennycuick-lesions,其中 lesions 指向病变相关对象。除图像数量与主题标签外,源站未提供关于图像尺寸、通道数、分辨率、染色方式、样本类型、时间序列或三维结构等更细粒度的内容描述。

【采集与来源】

数据来源站为 idr.openmicroscopy.org,属于 Image Data Resource,即 IDR。源站将其描述为经策展的细胞/组织成像研究,遵循 OME 标准,并与 EMBL-EBI 相关联。该数据集为 IDR study idr0082-pennycuick-lesions 下的 experimentA。关于具体的成像仪器、采集参数、样本制备流程、实验条件与采集时间等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其肿瘤与肺癌主题以及细胞成像、组织成像和病变标签,该数据集可应用于肿瘤成像相关的观察与分析场景,例如细胞与组织形态的视觉检查、病变区域的识别研究,以及作为公开成像资源用于方法演示与教学。由于数据经 IDR 策展并以 OME 标准组织,也适合用于验证与 OME 兼容的成像数据处理流程。关于该数据集是否适用于特定算法训练、定量分析或临床相关研究,源站未提供明确说明。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 idr.openmicroscopy.org 访问,属于 IDR 平台上的公开研究资源。使用者可依据 IDR 平台提供的访问方式获取 experimentA 下的 3 幅图像。关于具体的下载格式、API 调用方式、图像查看工具与使用步骤,源站未提供进一步说明。

【质量与限制】

该数据集由 IDR 进行策展,遵循 OME 标准,来源为 EMBL-EBI 相关资源体系,具备平台层面的规范化组织。当前可确认的数据规模为 3 幅图像,实验为 experimentA。关于图像质量评价、标注完整性、是否存在缺失数据、批次效应或其它技术限制,源站未提供。由于图像数量有限,其在统计代表性方面的表现需结合具体研究目的判断,源站未就此给出结论。

【引用与许可】

该数据集来源于 IDR(idr.openmicroscopy.org),属于 IDR study idr0082-pennycuick-lesions 的 experimentA。关于具体的引用格式、作者列表、发表文献、许可协议类型与使用条款,源站未提供。使用者在引用或再利用前,应查阅来源站的相关说明以确认许可与署名要求。

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

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使用方式

数据集获取

源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-1251

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR study idr0082-pennycuick-lesions. Experiment: experimentA. Images: 3. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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