参与肺癌脑转移形成的新型转移抑制基因鉴定

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-57492

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为寻找可能受甲基化下调的潜在转移抑制因子，我们利用针对特定部位转移的肺癌细胞系模型进行了初步筛选。对来自原发性肺癌（LC）和脑转移的肿瘤组织进行了基因表达谱分析和qRT-PCR验证。进一步对HERC5的甲基化模式进行了表征。将三种人肺癌细胞系H1993、H1395与（SV40）转化的人支气管上皮细胞系BEAS-2B进行比较，以寻找可能特异性参与脑转移形成的基因。这些细胞系经5-氮杂-2’-脱氧胞苷处理，以寻找可能因甲基化而下调的基因。非致瘤性细胞系BEAS-2B用于对照5-氮杂-2’-脱氧胞苷处理后的应激反应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。