IDC PDMR-Texture-Analysis 纹理分析数据集
该数据集聚焦于多种癌症类型的影像纹理分析,涵盖尤文肉瘤/外周原始神经外胚层肿瘤、黑色素瘤、神经内分泌癌(NOS)、骨肉瘤、肛管鳞状细胞癌、尿路上皮-膀胱癌(NOS)、胰腺腺癌、直肠腺癌、结肠腺癌以及肺鳞状细胞癌等

基本信息
资源简介
IDC PDMR-Texture-Analysis 纹理分析数据集
IDC PDMR-Texture-Analysis 是一个面向肿瘤研究领域的公开影像数据集,来源站为 portal.imaging.datacommons.cancer.gov。该数据集聚焦于多种癌症类型的影像纹理分析,涵盖尤文肉瘤/外周原始神经外胚层肿瘤、黑色素瘤、神经内分泌癌(NOS)、骨肉瘤、肛管鳞状细胞癌、尿路上皮-膀胱癌(NOS)、胰腺腺癌、直肠腺癌、结肠腺癌以及肺鳞状细胞癌等。数据集共包含 175 名受试者,采集了 18 个患者来源异种移植癌症模型的连续非增强 T2 加权 MRI 图像,共计 514 幅。其核心目标在于支持研究人员利用神经网络和分类技术开发各类算法,以改进组织表征,尤其是形态学变化的识别与分析。
【数据集背景】
该数据集属于肿瘤影像研究领域,特别针对肺癌及其他多种癌症类型的纹理分析需求而构建。患者来源异种移植模型是临床前癌症研究的重要工具,能够在一定程度上保留原发肿瘤的生物学特征。通过提供连续的非增强 T2 加权 MRI 图像,该数据集旨在为算法开发提供标准化的影像资源,推动基于神经网络的分类技术和组织表征方法的进步。其主题标签覆盖了多种肉瘤、癌和黑色素瘤等,体现了跨癌种的研究价值。
【数据内容】
数据集包含 175 名受试者的影像数据,涉及 18 个患者来源异种移植癌症模型,共 514 幅连续非增强 T2 加权 MRI 图像。癌症类型包括尤文肉瘤/外周原始神经外胚层肿瘤、黑色素瘤、神经内分泌癌(NOS)、骨肉瘤、肛管鳞状细胞癌、尿路上皮-膀胱癌(NOS)、胰腺腺癌、直肠腺癌、结肠腺癌和肺鳞状细胞癌。肿瘤位置涵盖手臂、膀胱、臀部、结肠、肝脏、子宫肌层、胰腺、直肠、肩部和肩胛骨。这些图像为研究人员提供了多癌种、多部位的纹理分析素材。
【采集与来源】
该数据集来源于 portal.imaging.datacommons.cancer.gov,属于 IDC 集合中的 PDMR-Texture-Analysis 集合。源站描述指出,该集合包含 18 个患者来源异种移植癌症模型的连续非增强 T2 加权 MRI 图像,共 514 幅。关于具体的采集设备、扫描参数、时间跨度等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于利用神经网络和分类技术开发算法,以改进组织表征,特别是形态学变化的分析。研究人员可以基于这些连续非增强 T2 加权 MRI 图像,开展纹理分析、癌症分类、组织特征识别等研究。其多癌种和多肿瘤位置的特点,使其可用于跨癌种的算法验证和比较研究。
【使用方法】
源站描述建议研究人员访问 PDMR-Texture-Analysis 的 wiki 页面(https://doi.org/10.7937/3KQ0-YK19)以了解有关图像的更多信息,并获取该集合的任何支持性元数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、预处理步骤等,源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、标注准确性、样本平衡性、图像分辨率或任何限制的详细信息。使用者应参考源站 wiki 页面获取可能的补充说明。
【引用与许可】
源站提供了该数据集的 DOI:https://doi.org/10.7937/3KQ0-YK19。关于具体的引用格式、许可条款和使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=pdmr_texture_analysis
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
IDC collection PDMR-Texture-Analysis。癌症类型:尤文肉瘤 - 外周原始神经外胚层肿瘤、黑色素瘤、神经内分泌癌(非特指)、骨肉瘤、肛管鳞状细胞癌、尿路上皮 - 膀胱癌(非特指)、胰腺腺癌、直肠腺癌、结肠腺癌、肺鳞状细胞癌。肿瘤位置:手臂、膀胱、臀部、结肠、肝脏、子宫肌层、胰腺、直肠、肩部、肩胛骨。受试者:175。本集合包含18个患者来源异种移植癌症模型的连续非增强T2加权MRI(514幅图像),供研究人员利用神经网络和分类技术开发各种算法,以改进组织表征(形态学变化)。请参阅PDMR-Texture-Analysis(https://doi.org/10.7937/3KQ0-YK19)wiki页面,以了解有关图像的更多信息并获取本集合的任何支持性元数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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