亲水相互作用液相色谱助力人唾液N-糖蛋白组学整合分析用于肺癌研究

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD030670

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们旨在深入表征和定量唾液N-糖蛋白组学。将HILIC富集与LC-MS/MS相结合，在去糖肽水平和糖肽水平上研究唾液糖基化，并检测肺癌患者与健康受试者之间人唾液位点特异性糖型的改变。首先，利用HILIC从人唾液中富集完整糖肽。获得的完整糖肽直接通过LC-MS/MS进行表征。此外，经PNGase F孵育后，通过LC-MS/MS全面鉴定糖基化位点。所建立的工作流程被应用于比较肺癌组和健康对照组中的N-糖基化位点和完整N-糖肽。在肺癌中确信地观察到失调的N-糖基化位点以及位点特异性糖型，其在临床应用中的潜在价值将被讨论。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。