Mob1DKO小鼠肺基因表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE93778

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Mps One Binder激酶激活因子(MOB)1A/1B是Hippo通路的核心组分。这些蛋白可协同激活大型肿瘤抑制因子同源物(LATS)激酶，本身也是肿瘤抑制因子。为研究MOB1A/B在正常生理和肺癌中的作用，我们构建了多西环素(Dox)诱导型、细支气管肺泡上皮特异性的MOB1A/B缺失突变小鼠[SPC-rtTA/(tetO)7-Cre/Mob1aflox/flox/Mob1b-/-；称为luMob1DKO小鼠]。多数在子宫内接受Dox的突变体[luMob1DKO (E6.5-18.5)小鼠，占70%]在出生后1小时内死于缺氧。其肺泡上皮细胞增殖增加、YAP1/TAZ依赖性分化受损、表面活性蛋白产生减少，这些均为人类呼吸窘迫综合征(RDS)的特征。有趣的是，出生后接受Dox的突变小鼠[luMob1DKO (P21–41)小鼠]未发生自发性肺腺癌，且氨基甲酸乙酯诱导的肺肿瘤形成减少(而非增加)。

luMob1DKO小鼠（P21–41）的肺组织表现出细支气管上皮细胞脱落增加，以及被认为可启动肺腺癌的细支气管肺泡干细胞（BASCs）数量减少。YAP1/TAZ-NKX2.1依赖的XVII型胶原蛋白（一种关键的半桥粒组分）表达也降低。因此，MOB1-YAP1/TAZ-NKX2.1轴对于正常肺稳态以及肺微环境中维持肺泡干细胞所必需的XVII型胶原蛋白表达至关重要。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。