GSE88908:Igf1r缺陷减轻博来霉素诱导肺损伤后的急性炎症反应和氧化应激

研究使用出生后Igf1r缺陷小鼠及博来霉素诱导肺损伤模型,分析肺转录组,发现表观遗传、炎症/免疫反应和氧化应激相关基因转录普遍受抑制,突变小鼠早期存活改善、肺损伤和炎症较轻

geo
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基因组分类GPL1100210090
GSE88908: Igf1r deficiency attenuates acute inflammatory response and oxidative stress following bleomycin-induced lung injury

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

GSE88908:Igf1r缺陷减轻博来霉素诱导肺损伤后的急性炎症反应和氧化应激

Igf1r deficiency attenuates acute inflammatory response and oxidative stress following bleomycin-induced lung injury

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件GSE88908_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序表达谱分析。研究使用出生后Igf1r缺陷小鼠及博来霉素诱导肺损伤模型,分析肺转录组,发现表观遗传、炎症/免疫反应和氧化应激相关基因转录普遍受抑制,突变小鼠早期存活改善、肺损伤和炎症较轻。数据可用于探索IGF1R在肺炎症及肺癌、COPD、哮喘、肺纤维化等炎症相关肺病中的作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 18 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):IGF1R(胰岛素样生长因子1受体)是一种广泛表达的跨膜酪氨酸激酶受体,具有包括炎症在内的多种功能。IGF活性维持人肺稳态,参与具有炎症成分的相关肺部疾病,如肺癌、COPD、哮喘和肺纤维化。在此,我们使用出生后Igf1r缺陷小鼠和博来霉素(BLM)诱导的肺损伤模型,检查了IGF1R在肺部炎症中的作用。Igf1r缺陷小鼠的肺转录组分析显示,与表观遗传学、炎症/免疫反应和氧化应激活性相关的基因转录普遍受到抑制,这些基因具有潜在的肺保护作用。气管内BLM治疗早期,突变小鼠表现出存活改善和较轻的肺损伤及炎症。它们的肺呈现巨噬细胞下调

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL11002、10090。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE88908

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IGF1R(胰岛素样生长因子1受体)是一种广泛表达的跨膜酪氨酸激酶受体,具有包括炎症在内的多种功能。IGF活性维持人肺稳态,参与具有炎症成分的相关肺部疾病,如肺癌、COPD、哮喘和肺纤维化。本研究利用出生后Igf1r缺陷小鼠及博来霉素(BLM)诱导的肺损伤模型,探讨了IGF1R在肺部炎症中的作用。对Igf1r缺陷小鼠的肺转录组分析显示,与表观遗传学、炎症/免疫反应及氧化应激活性相关的基因转录普遍受到抑制,这些基因具有潜在的肺保护作用。在气管内BLM treatment早期,突变小鼠表现出生存率改善及肺损伤和炎症减轻。其肺组织中巨噬细胞(Marco/Adgre1)、中性粒细胞相关(Cxcl1/Ly6g)、促炎(Tnf/Il1b/Il6)、内皮黏附(Icam1/Pecam1)及肺泡损伤(Aqp5/Sftpc)标志物表达下调,而消退期标志物(Csf1/Il13/Cd209a)表达上调。

同时,也发现了IGF系统基因mRNA的变化,这与对缺氧反应受阻(Hif1a)和抗氧化应激标志物Gpx8表达增加相平行。这些发现表明Igf1r在氧化应激和炎症中扮演重要角色,并提示靶向Igf1r可能阻断伴有此成分的肺部疾病中的炎症反应。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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