GSE88836:Igf1r在细支气管上皮再生中的作用及选择性Club细胞消融后修复动力学

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE88836_series_matrix.txt.gz),主题为肿瘤/肺癌,采用高通量测序进行表达谱分析

geo
浏览 2
时间序列GPL1100210090
GSE88836: Involvement of Igf1r in Bronchiolar Epithelial Regeneration: Role During Repair Kinetics after Selective Club Cell Ablation

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

GSE88836:Igf1r在细支气管上皮再生中的作用及选择性Club细胞消融后修复动力学

Involvement of Igf1r in Bronchiolar Epithelial Regeneration: Role During Repair Kinetics after Selective Club Cell Ablation

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE88836_series_matrix.txt.gz),主题为肿瘤/肺癌,采用高通量测序进行表达谱分析。源站描述聚焦Igf1r在肺上皮再生中的作用,涉及选择性Club细胞消融后修复动力学,并提及在两种肺上皮特异性Igf1r突变小鼠中开展研究。数据可用于探索IGF信号通路与肺上皮损伤修复及相关呼吸疾病的关系(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 17 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肺上皮的再生对于维持气道功能和完整性至关重要。上皮损伤与修复之间的失衡是多种慢性肺病(如哮喘、COPD、肺纤维化和肺癌)的基础。IGF(胰岛素样生长因子)信号传导与大多数这些呼吸系统病理相关,尽管其在该组织中的作用机制仍知之甚少。在小鼠肺中进行的IGF系统基因表达谱分析支持它们参与肺个体发育的功能。免疫定位显示Igf1r(胰岛素样生长因子1受体)在肺上皮细胞、肺泡巨噬细胞和平滑肌中高表达。为进一步了解Igf1r在肺稳态中的作用,生成并研究了两种不同的肺上皮特异性Igf1r突变小鼠。缺乏Igf1r d

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL11002、10090。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE88836

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE88836

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺上皮的再生对于维持气道功能和完整性至关重要。上皮损伤与修复之间的失衡是众多慢性肺病(如哮喘、COPD、肺纤维化和肺癌)的基础。IGF(胰岛素样生长因子)信号传导与大多数此类呼吸系统病理相关,尽管其在该组织中的作用机制仍知之甚少。在小鼠肺中进行的IGF系统基因表达谱分析支持其在肺个体发育中的功能参与。免疫定位显示,Igf1r(胰岛素样生长因子1受体)在肺上皮细胞、肺泡巨噬细胞和平滑肌中高表达。为进一步了解Igf1r在肺稳态中的作用,研究人员构建并研究了两种不同的肺上皮特异性Igf1r突变小鼠。Igf1r的缺失扰乱了成年小鼠的气道上皮分化,表现为远端气道棒状细胞增殖增强和形态改变。

在萘诱导的棒状细胞损伤后的恢复过程中,Igf1r突变体的终末细支气管上皮再生动力学受到阻碍,表现为棒状细胞和纤毛细胞的增殖增加和分化延迟。在气道修复过程中,Igf1r缺陷小鼠的肺显示出Igf1、Insr、Igfbp3和上皮前体标志物水平升高,Scgb1a1蛋白含量减少,以及IGF信号传导介质的改变。这些结果支持Igf1r在损伤后肺气道上皮再生过程中控制细胞增殖和分化动力学的作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案