GSE86344：肺癌细胞系中S100A7A调控的RNA-Seq差异表达分析
该数据集来自NCBI GEO（GSE86344），针对肺癌细胞系开展RNA-Seq分析，比较S100A7A导入与Cl1-0对照、以及S100A7A敲低与CL1-5对照的差异表达基因
基本信息
资源简介
GSE86344：肺癌细胞系中S100A7A调控的RNA-Seq差异表达分析
RNA-Seq analysis facilitates quantitative analysis to identify DEGs in lung cancer cell lines regulated by S100A7A introduction in comparison with Cl1-0 control and S100A7A knockdown in comparison with CL1-5 control.
该数据集来自NCBI GEO（GSE86344），针对肺癌细胞系开展RNA-Seq分析，比较S100A7A导入与Cl1-0对照、以及S100A7A敲低与CL1-5对照的差异表达基因。数据包含每组3个混合培养细胞样本的cDNA文库，使用Illumina MiSeq平台测序生成RNA表达谱，共1个文件（GSE86344_series_matrix.txt.gz）。可用于肺癌细胞系中S100A7A调控的差异表达基因识别与表达谱分析（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Sep 01 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：方法：每组3个混合培养细胞样本的cDNA文库使用Illumina Miseq平台测序以生成RNA表达谱
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL15520、9606。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE86344
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 25 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE86344
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
方法：对每组3份混合培养细胞样本的cDNA文库进行测序，利用Illumina Miseq平台生成RNA图谱。结果：测序运行共获得95.01 M reads，平均长度为73-74 bp。对不同处理肝脏样本进行的高通量测序显示，获得的reads数量相似，范围为5.57至5.74 M，且平均长度相同。使用Strand NGS软件（版本2.1）并采用默认参数进行比对前和比对后的质量控制分析，100%的原始reads保留在数据集中。其中，19.02 M reads（84%）比对到大鼠基因组（rn5）的contigs上，并在肝脏样本中鉴定出31457个转录本。
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