耐药EGFR突变肺腺癌转化为SCLC过程中RB选择性缺失的CGH数据集
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE64765,聚焦EGFR突变肺腺癌在TKI耐药后转化为小细胞肺癌(SCLC)过程中RB基因的选择性缺失
![GSE64765: Selective Loss of RB in Resistant EGFR Mutant Lung Adenocarcinomas that Transform to SCLC [CGH]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/145505.jpg)
基本信息
资源简介
耐药EGFR突变肺腺癌转化为SCLC过程中RB选择性缺失的CGH数据集
Selective Loss of RB in Resistant EGFR Mutant Lung Adenocarcinomas that Transform to SCLC [CGH]
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE64765,聚焦EGFR突变肺腺癌在TKI耐药后转化为小细胞肺癌(SCLC)过程中RB基因的选择性缺失。数据通过SNP array进行基因组变异分析,平台为GPL16237,物种为9606(人类)。数据集包含1个文件(GSE64765_series_matrix.txt.gz),可用于研究耐药EGFR突变NSCLC向SCLC转化相关的分子变化,支持基因组变异层面的分类与比较分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 07 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该研究旨在识别EGFR突变非小细胞肺癌(NSCLC)通过转化为小细胞肺癌(SCLC)而对TKI产生耐药时所发生的分子变化。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Genome variation profiling by SNP array、GPL16237、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE64765
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 20 201,引用时请注意版本时效。
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数据说明
本研究旨在识别EGFR突变型非小细胞肺癌(NSCLC)在转化为小细胞肺癌(SCLC)并对酪氨酸激酶抑制剂(TKI)产生耐药过程中所发生的分子变化。酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)是治疗伴有表皮生长因子受体(EGFR)突变的非小细胞肺癌(NSCLC)的有效手段。然而,它们并不能实现治愈,平均而言,在持续治疗一年后会出现复发。在一部分患者中,可观察到耐药性癌症发生了从NSCLC向小细胞肺癌(SCLC)的根本性组织学转化,但与这一转化相关的分子变化仍不清楚。对来自发生SCLC转化的耐药EGFR突变患者的肿瘤样本和细胞系队列进行分析显示,在这些病例中RB缺失率达100%,而在仍保持NSCLC的病例中则罕见。在转化为SCLC的癌症中,可观察到基因表达的全局性变化,包括神经内分泌标志物表达增加以及EGFR表达缺失。
与经典SCLC在遗传学和表观遗传学上的相似性一致,源自耐药EGFR突变型SCLC活检组织的细胞系对ABT-263治疗的敏感性显著高于源自耐药EGFR突变型NSCLC的细胞系。综上所述,这些发现表明,尽管这些耐药癌症最初以EGFR突变腺癌的形式发展,但这一亚群最终呈现出经典SCLC的许多分子和表型特征。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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