A549 人 NSCLC 细胞系中 ENTPD1/CD39 与 NT5E/CD73 的 ATACseq
研究将培养的 A549 肺腺癌细胞暴露于 IFNγ 和 TNFα,发现 CD73 蛋白表达被诱导,并对对照与处理细胞的 DNA 进行 ATAC-seq,以探索促炎状态下 CD73 表达升高的机制

基本信息
资源简介
A549 人 NSCLC 细胞系中 ENTPD1/CD39 与 NT5E/CD73 的 ATACseq
ATACseq of ENTPD1/CD39 and NT5E/CD73 in A549 human NSCLC cell lines
该数据集为 A549 人非小细胞肺癌细胞系中 ENTPD1/CD39 与 NT5E/CD73 的 ATAC-seq 数据,来源为 NCBI GEO,包含 1 个文件 GSE347110_series_matrix.txt.gz。研究将培养的 A549 肺腺癌细胞暴露于 IFNγ 和 TNFα,发现 CD73 蛋白表达被诱导,并对对照与处理细胞的 DNA 进行 ATAC-seq,以探索促炎状态下 CD73 表达升高的机制。数据可用于分析染色质可及性变化、研究 CD39/CD73 通路在肺癌炎症微环境中的调控(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 13 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):鉴于近期临床试验显示 CD73 阻断抗体与 PD-L1 拮抗剂联用具有显著抗肿瘤活性,理解人肺恶性肿瘤中 CD39/CD73 通路的特性已成为一项突出需求。为确定炎症 TME 中常见上调的促炎细胞因子是否能调节 CD39 和 CD73 表达水平,我们将培养的人 A549 肺腺癌细胞暴露于 IFNγ 和 TNFα,发现 CD73 蛋白表达被诱导。利用 ATAC-seq,我们分析了从这些对照和处理细胞制备物中提取的 DNA,目的是探索促炎状态下 CD73 表达升高的潜在机制。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE347110
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 16 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
鉴于近期临床试验表明,CD73阻断抗体与PD-L1拮抗剂联合具有显著抗肿瘤活性,了解CD39/CD73通路在人肺恶性肿瘤中的特性已凸显出迫切需求。为确定炎症性肿瘤微环境(TME)中常上调的促炎细胞因子是否能调节CD39和CD73的表达水平,我们将培养的人A549肺腺癌细胞暴露于IFNγ和TNFα,发现CD73蛋白表达被诱导。我们使用ATAC-seq分析了从这些对照和经处理细胞制备物中提取的DNA,旨在探究促炎状态下CD73表达增加的机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




