肺神经内分泌癌经血清素诱导免疫抑制巨噬细胞驱动tarlatamab耐药 [Xenium]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为肺神经内分泌癌经血清素诱导免疫抑制巨噬细胞驱动对 T 细胞衔接器 tarlatamab 的耐药 [Xenium],仅含 1 个文件 GSE347080_series_matrix.txt.gz,作者为 Kotaro Nomura,发布时间为 Sep 13 202

geo
浏览 15
基因组分类OtherGPL337629606
GSE347080: Lung neuroendocrine cancer induces immunosuppressive macrophages via serotonin to drive resistance to the T cell engager tarlatamab [Xenium]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

肺神经内分泌癌经血清素诱导免疫抑制巨噬细胞驱动tarlatamab耐药 [Xenium]

Lung neuroendocrine cancer induces immunosuppressive macrophages via serotonin to drive resistance to the T cell engager tarlatamab [Xenium]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为肺神经内分泌癌经血清素诱导免疫抑制巨噬细胞驱动对 T 细胞衔接器 tarlatamab 的耐药 [Xenium],仅含 1 个文件 GSE347080_series_matrix.txt.gz,作者为 Kotaro Nomura,发布时间为 Sep 13 202。数据聚焦 DLL3 高表达神经内分泌癌(NEC)通过 TPH1 上调增加 5-HT 生成,进而增强表达 HTR7 的肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制活性,导致 CD8+ T 细胞功能受损和 tarlatamab 耐药。可用于研究 SCLC 与 LCNEC 的耐药机制及巨噬细胞相关免疫调控(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 13 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Tarlatamab 是一种靶向 DLL3/CD3 的 T 细胞衔接器(TCE),对小细胞肺癌(SCLC)具有临床疗效,但其疗效仍然有限,这表明阐明耐药机制的重要性。在此,我们表明,由 DLL3 高表达神经内分泌癌(NEC)产生的血清素(5-HT)诱导免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞(TAM),导致 CD8+ T 细胞功能受损和 TCE 耐药。使用 SCLC 和大细胞神经内分泌癌(LCNEC)患者队列,我们发现 DLL3 高表达 SCLC 在肿瘤微环境中诱导免疫抑制性 TAM,并对 tarlatamab 产生耐药。DLL3 高表达 NEC 通过 TPH1 上调增加 5-HT 产生。NEC 来源的 5-HT 增强了表达 5-HT 受体 7(HTR7)的 TAM 的免疫抑制活性。在 TAM 中基因敲除 HTR7 或在 NEC 中敲除 TPH1 可恢复 CD8+ T 细胞功能和 imp

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Other、GPL33762、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE347080

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 30 202,引用时请注意版本时效。

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE347080

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Tarlatamab是一种靶向DLL3/CD3的T细胞衔接器(TCE),对小细胞肺癌(SCLC)具有临床疗效,尽管其疗效仍然有限,这提示阐明其耐药机制的重要性。在此,我们表明,由DLL3高表达神经内分泌癌(NEC)产生的5-羟色胺(5-HT)可诱导免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞(TAM),从而导致CD8+ T细胞功能受损和TCE耐药。利用SCLC和大细胞神经内分泌癌(LCNEC)患者队列,我们发现DLL3高表达SCLC在肿瘤微环境中诱导免疫抑制性TAM,并对tarlatamab产生耐药。DLL3高表达NEC通过TPH1上调增加5-HT产生。NEC来源的5-HT增强了表达5-HT受体7(HTR7)的TAM的免疫抑制活性。对TAM中的HTR7或NEC中的TPH1进行基因消融,可恢复CD8+ T细胞功能,并提高TCE和PD-1阻断的疗效。我们提出,NEC来源的5-HT–HTR7轴驱动免疫抑制性TAM激活和TCE耐药,使其成为提高TCE疗效的关键靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。