GSE346254：肺癌肿瘤RNA测序
GSE346254 是一份以肺癌肿瘤为对象的 RNA 测序表达数据集，源自 NCBI，收录了 18 例肺癌患者样本的 bulk RNA-seq 表达数据，本站将其归入肿瘤／肺癌分类
基本信息
资源简介
GSE346254：肺癌肿瘤RNA测序
GSE346254 是一份以肺癌肿瘤为对象的 RNA 测序表达数据集，源自 NCBI，收录了 18 例肺癌患者样本的 bulk RNA-seq 表达数据，本站将其归入肿瘤／肺癌分类。
【数据集背景】
该数据集的英文名称与源站标题均为 RNA-seq of Lung Cancer tumors，主题标签标注为 Expression profiling by high throughput sequencing，并关联平台编号 GPL24676 与物种编号 9606，说明其面向人类样本、采用高通量测序手段进行表达谱分析。数据集的作者信息标注为 Eric，Q，Konnick，发布信息标注为 Sep 04 202。就研究方向而言，它属于肿瘤学下的肺癌转录组范畴，关注的是肺癌组织的基因表达情况。至于该研究的具体立项背景、科学假设、资助来源以及所属课题组的整体研究脉络，源站未提供。
【数据内容】
按照源站描述，该数据集收集了 18 例肺癌患者样本，并对其进行了 bulk RNA-seq 表达检测，因此其核心内容是这批样本的基因表达谱。数据集对外提供的文件数量为 1，文件样例为 GSE346254_series_matrix.txt.gz，从命名可以看出这是一份经过 GZIP 压缩的表达矩阵文件，通常用于承载样本与基因层面的表达数值以及配套的样本标注信息。样本的组织亚型、病理分型、分期分级、治疗状态，以及测序深度、读长、比对流程与表达定量方法等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 旗下公共数据资源中的数据条目，用户可通过源站访问与获取。数据来源对象为肺癌患者，共 18 例，采集方式为 bulk RNA-seq，用以获得肿瘤样本的转录组表达信息。主题标签中给出的平台编号 GPL24676 与物种编号 9606，分别指向所使用的测序平台与人类这一物种。有关样本采集机构、伦理审查与知情同意情况、采样时间与地点、样本入组标准等信息，源站未提供。
【适用场景】
作为一份人类肺癌的 bulk RNA-seq 表达数据集，它可用于肺癌转录组表达谱的观察性分析、基因表达层面的比较研究，以及在此基础上开展的差异表达探索与候选标志物初步筛查等一般性研究用途。同时，这类表达矩阵数据也常被用于方法学验证、分析流程搭建与教学演示等场景。需要说明的是，具体到本数据集能够支撑哪些特定分析目标、是否适用于某一类验证性研究，仍需以实际数据内容与配套注释为准，相关说明源站未提供。
【使用方法】
使用时先在源站获取数据文件 GSE346254_series_matrix.txt.gz，并按 GZIP 压缩包的格式进行读取与解压。由于该文件以矩阵形式组织表达信息，建议先在小样本上核对字段结构、样本标识与编码方式，确认解析结果与预期一致后，再批量接入后续分析流程，以避免因字段错位或编码差异导致整体处理出错。
【质量与限制】
该数据集共纳入 18 例肺癌患者样本，对外文件数量为 1，整体规模相对有限；其表达矩阵文件已进行压缩封装，便于传输与存储。至于测序质量评分、碱基质量分布、比对率、重复样本一致性、批次效应、缺失值与异常值情况等质量控制指标，源站未提供。此外，样本的临床与随访信息、注释完整程度亦缺少说明。因此在实际使用前，建议结合数据文件本身自行核查字段完整性与数据质量，并谨慎解读基于该数据集得出的结论。
【引用与许可】
该数据集的作者信息标注为 Eric，Q，Konnick，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布信息标注为 Sep 04 202。关于数据的引用格式、使用许可、二次分发条件与商业使用限制等事项，源站未提供，使用者应自行前往来源站查阅相应条款后再行使用与引用。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE346254
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们收集了18份肺癌患者样本，并对其进行了bulk RNA-seq表达分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
