H2122 KRAS G12C突变非小细胞肺癌异种移植瘤经sotorasib、avutometinib和VS-4718联合治疗的RNA-seq分析
该数据集来自NCBI GEO,对H2122(KRAS G12C突变非小细胞肺癌)细胞系来源的异种移植瘤进行RNA测序,肿瘤分别接受vehicle、sotorasib、avutometinib、VS-4718及其两两联合和三联联合治疗

基本信息
资源简介
H2122 KRAS G12C突变非小细胞肺癌异种移植瘤经sotorasib、avutometinib和VS-4718联合治疗的RNA-seq分析
RNA-seq analysis of H2122 KRAS G12C mutant NSCLC xenografts treated with sotorasib, avutometinib, and VS-4718 combinations
该数据集来自NCBI GEO,对H2122(KRAS G12C突变非小细胞肺癌)细胞系来源的异种移植瘤进行RNA测序,肿瘤分别接受vehicle、sotorasib、avutometinib、VS-4718及其两两联合和三联联合治疗。数据包含1个文件(GSE345564_series_matrix.txt.gz),可用于分析KRAS G12C、MEK和FAK联合抑制相关的转录组变化,包括差异表达和基因集富集分析,涉及细胞外基质组织和黏着斑信号通路(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 31 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):对H2122(KRAS G12C突变非小细胞肺癌)细胞系来源的异种移植瘤进行RNA测序,肿瘤分别接受vehicle、sotorasib、avutometinib、VS-4718或其两两联合及三联联合治疗,以表征联合抑制KRAS G12C、MEK和FAK的抗肿瘤活性所 underlying 的转录变化。对人(肿瘤)reads的差异表达和基因集富集分析发现,与联合治疗相关的细胞外基质组织和黏着斑信号通路发生变化。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE345564
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 13 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
对H2122(KRAS G12C突变非小细胞肺癌)细胞系来源的异种移植瘤进行了RNA测序,这些肿瘤分别接受了溶媒、sotorasib、avutometinib、VS-4718或其两两组合及三药联合治疗,以表征联合抑制KRAS G12C、MEK和FAK所产生抗肿瘤活性背后的转录变化。对人(肿瘤)reads的差异表达和基因集富集分析发现,细胞外基质组织和黏着斑信号通路的变化与联合治疗相关。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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