GSE344891：靶向不同细胞周期节点克服KRAS/RAS抑制剂耐药

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE344891

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数据说明

KRAS 激活突变驱动胰腺导管腺癌（PDAC）和非小细胞肺癌（NSCLC）。尽管突变选择性 KRAS 抑制剂和泛 RAS 抑制剂可带来临床获益，但耐药性的产生限制了持久缓解。转录组学和蛋白质组学分析显示，尽管突变 KRAS 信号被有效抑制，耐药细胞仍维持细胞周期进展。不同的正交促有丝分裂通路以情境依赖的方式被激活，从而绕过 KRAS 抑制。虽然使用泛 RAS-ON 抑制剂 RMC-6236 可广泛抑制这些通路，但细胞仍能够产生获得性耐药，此时细胞增殖与 RAS 信号解偶联。组合药物筛选和全基因组 CRISPR-Cas9 筛选显示，通过靶向细胞周期蛋白依赖性激酶 CDK4/6 和 CDK2 来扰动细胞周期节点，可恢复对 KRAS/RAS 抑制剂的敏感性。共同靶向 CDK4/6 可诱导 G1 期阻滞，并在所有耐药模型中抑制 E2F 调控的蛋白。

相比之下，联合靶向 CDK2 通过损害 DNA 复制、诱导 G2 期阻滞、阻止进入有丝分裂，并产生更持久的细胞静止反应，从而延缓停药后的细胞扩增，发挥更广泛的作用。最后，同时抑制 KRAS 与 CDK4/6 或 CDK2，可在源自获得性耐药模型的异种移植瘤中实现体内持久的肿瘤控制。总之，我们的研究结果将持续的细胞周期活动确定为 KRAS 靶向治疗耐药的决定性特征，并确立细胞周期联合靶向是克服 KRAS/RAS 抑制剂耐药的有效策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。