小细胞肺癌空间分辨细胞通讯揭示巨噬细胞驱动的免疫逃逸程序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE343063

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小细胞肺癌（SCLC）尽管存在大量免疫细胞浸润，但对免疫治疗的反应却很差。我们利用10x Genomics Xenium In Situ平台（5K Human Pan Tissue & Pathways Panel），对来自六个手术切除的局限期SCLC肿瘤的超过250万个细胞进行了单细胞空间转录组学分析。空间分辨的细胞间通讯分析确定巨噬细胞是主要的通讯免疫细胞群，并揭示了与不同T细胞表型和免疫逃逸程序相关的不同空间巨噬细胞状态。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。