osimertinib诱导耐药持留细胞的RNA-seq数据
研究通过对osimertinib诱导的DTP细胞进行RNA-seq，分析差异表达基因，以识别调控DTP细胞的分子机制。数据可用于肺癌耐药持留细胞相关基因表达分析、差异表达基因筛选及分子机制探索（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
osimertinib诱导耐药持留细胞的RNA-seq数据
GSE341996 是一个聚焦于肺癌耐药持留细胞（drug-tolerant persisters，DTP）的 RNA-seq 数据集，来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），标题为“RNA-seq data in osimertinib-induced drug-tolerant persisters cells”。该数据集的核心目标是通过对 osimertinib 诱导产生的 DTP 细胞进行转录组测序，分析其差异表达基因，从而识别调控 DTP 细胞的分子机制。数据集归属于肿瘤 / 肺癌分类，包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE341996_series_matrix.txt.gz，作者为 Xiang，Meng，发布时间为 Jul 30 202。主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL24676 平台以及物种编号 9606，整体可用于肺癌耐药持留细胞相关基因表达分析、差异表达基因筛选及分子机制探索。
【数据集背景】
该数据集围绕 osimertinib 诱导的耐药持留细胞展开。Osimertinib 是肺癌靶向治疗中常用的药物，而 DTP 细胞是肿瘤在药物压力下进入的一种可逆的耐药持留状态，理解其分子调控机制对于克服耐药、改善肺癌治疗策略具有重要意义。源站描述指出，研究的目的是识别调控 DTP 细胞的分子机制，因此对 osimertinib 诱导的 DTP 细胞进行了 RNA-seq，以分析差异表达基因。该数据集属于肿瘤 / 肺癌研究领域，主题标签中包含 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676 和 9606，表明其采用高通量测序进行表达谱分析，涉及人类样本，并使用 GPL24676 平台。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE341996_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式，属于 RNA-seq 表达谱数据。源站描述说明，该数据用于分析 osimertinib 诱导的 DTP 细胞中的差异表达基因，以识别调控 DTP 细胞的分子机制。数据内容围绕基因表达谱展开，可用于比较 DTP 细胞与对照条件下的表达差异，进而筛选差异表达基因。主题标签中的 Expression profiling by high throughput sequencing 表明数据通过高通量测序获得，GPL24676 则对应具体的测序平台信息，9606 对应人类物种。除上述信息外，源站未提供更详细的样本数量、分组设计、测序深度或具体基因列表。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题为“RNA-seq data in osimertinib-induced drug-tolerant persisters cells”。作者为 Xiang，Meng，发布时间为 Jul 30 202。数据通过 RNA-seq 技术对 osimertinib 诱导的 DTP 细胞进行测序获得，目的是分析差异表达基因并识别调控 DTP 细胞的分子机制。主题标签中的 GPL24676 提供了平台信息，9606 表明研究对象为人类。数据集分类为肿瘤 / 肺癌，说明其与肺癌研究直接相关。除上述来源信息外，源站未提供样本采集地点、伦理审批信息、具体细胞系或动物模型等细节。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌耐药持留细胞相关的基因表达分析。具体而言，可用于分析 osimertinib 诱导的 DTP 细胞中的基因表达变化，筛选差异表达基因，并探索调控 DTP 细胞的分子机制。由于主题标签涉及高通量测序表达谱，该数据也可用于转录组水平的比较研究，例如 DTP 细胞与对照细胞之间的表达谱差异。此外，该数据集可服务于肺癌耐药机制研究、药物持留状态相关通路分析以及潜在靶点发现等场景。侧写线索指出，数据可用于肺癌耐药持留细胞相关基因表达分析、差异表达基因筛选及分子机制探索。除上述适用方向外，源站未提供其他具体应用案例或验证结果。
【使用方法】
使用该数据集时，可先下载数据文件 GSE341996_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式，需按相应格式进行读取和解压。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因格式或编码问题导致分析错误。由于文件为 series matrix 格式，通常包含样本信息与表达矩阵，可用于后续差异表达分析。使用过程中应结合主题标签中的平台信息（GPL24676）和物种信息（9606）进行注释与比对。除上述基本使用步骤外，源站未提供具体的分析流程、软件推荐或参数设置。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，样例为 GSE341996_series_matrix.txt.gz，文件数量有限。源站描述未提供样本数量、重复数、测序深度、质量控制指标或数据完整性说明。主题标签提供了平台和物种信息，但未提供详细的实验设计、批次信息或归一化方法。因此，在使用该数据时，需自行评估数据质量，并注意其可能存在的局限性，例如样本量未知、缺乏对照信息或平台特异性偏差。此外，发布时间为 Jul 30 202，但年份信息不完整，可能影响数据时效性判断。除上述内容外，源站未提供其他质量评估或限制说明。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Xiang，Meng，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。使用时应遵循 NCBI 的相关数据使用与引用规范。源站未提供具体的许可协议、引用格式或使用限制说明。建议在引用时注明数据集标题“RNA-seq data in osimertinib-induced drug-tolerant persisters cells”及来源 NCBI。除上述信息外，源站未提供其他许可或引用细节。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE341996
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为了识别调控DTP细胞的分子机制，我们对奥希替尼诱导的DTP细胞进行了RNA-seq分析，以研究差异表达基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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