XCR1+与CD11b+迁移性树突状细胞协同交叉致敏瘤内CD8+ T细胞并赋予组织驻留记忆表型

该数据集来自小鼠肺癌模型,研究XCR1+ DC1与CD11b+ DC2两类迁移性树突状细胞亚群对肿瘤浸润CD8+ T细胞不同亚型生成的影响

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基因组分类GPL3017210090
GSE337798: XCR1+ and CD11b+ migratory dendritic cells cooperate for the crosspriming of intratumoral CD8+ T cells with a tissue-resident memory phenotype

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

XCR1+与CD11b+迁移性树突状细胞协同交叉致敏瘤内CD8+ T细胞并赋予组织驻留记忆表型

XCR1+ and CD11b+ migratory dendritic cells cooperate for the crosspriming of intratumoral CD8+ T cells with a tissue-resident memory phenotype

该数据集来自小鼠肺癌模型,研究XCR1+ DC1与CD11b+ DC2两类迁移性树突状细胞亚群对肿瘤浸润CD8+ T细胞不同亚型生成的影响。数据通过高通量测序进行表达谱分析,覆盖肿瘤浸润与肿瘤引流淋巴结中的CD8+ T细胞及树突状细胞相关样本。可用于探索DC1与DC2在交叉致敏、T细胞耗竭及组织驻留记忆表型形成中的分工与协同机制,为肺癌抗肿瘤免疫研究提供转录组层面的数据支持(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 07 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肿瘤浸润CD8+ T细胞群体的组成和多样性对抗肿瘤免疫的发展具有重要影响。在一种小鼠肺癌模型中,我们研究了树突状细胞亚群对各类肿瘤浸润CD8+ T细胞生成的作用。我们发现,CD44+PD1-效应型和PD1+TIM3+耗竭型肿瘤浸润CD8+ T细胞需要XCR1+ DC1s,但不需要依赖IRF4的CD11b+ DC2s。相比之下,CD103+CD69+ TRM样肿瘤浸润CD8+ T细胞同时需要DC1s和DC2s。在肿瘤引流淋巴结中也发现了相同的需求,我们在那里鉴定出依赖XCR1+ DC1s和CD11b+迁移性DC2s的CD103+ TRM样前体细胞。在机制上,我们证明两类迁移性树突状细胞协同作用。交叉呈递的迁移性DC2s表面低MHCI-肽密度引起的轻度TCR触发以及低IL-12

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL30172、10090。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE337798

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 08 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤浸润性CD8+ T细胞群体的组成和多样性对抗肿瘤免疫的发展具有重要影响。在肺癌小鼠模型中,我们探讨了树突状细胞亚群在各类肿瘤浸润性CD8+ T细胞生成中的作用。我们发现,CD44+PD1-效应型和PD1+TIM3+耗竭型肿瘤浸润性CD8+ T细胞需要XCR1+ DC1s,但不需要IRF4依赖的CD11b+ DC2s。相比之下,CD103+CD69+ TRM样肿瘤浸润性CD8+ T细胞则需要DC1s和DC2s两者。在肿瘤引流淋巴结中也发现了相同的需求,我们在其中鉴定出依赖XCR1+ DC1s和CD11b+迁移性DC2s两者的CD103+ TRM样前体细胞。在机制上,我们证明两种迁移性树突状细胞协同作用。交叉呈递迁移性DC2s表面低MHCI-肽密度引起的轻度TCR触发以及低IL-12支持淋巴结中TGFb依赖的TRM特化。交叉呈递迁移性DC1s表面高TCR触发和高MHCI-肽密度以及高IL-12支持增殖性扩增和CXCR6获得。

总之,这些发现强调了在肿瘤引流淋巴结内多个DC亚群的共同作用下,肿瘤内TRM样细胞的诱导,协调了TRM表型指令与增殖扩增。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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