GSE336982：肥胖通过气道免疫功能障碍促进肺癌发生

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336982

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

理由：尽管肥胖与抗肿瘤免疫功能失调之间存在明确联系，但高身体质量指数却与肺癌风险降低相关，从而引出了“肥胖悖论”。目的：我们旨在通过临床和临床前模型来阐明这一关系并获得机制性见解。方法与测量：一项针对早期肺癌风险的病例对照研究在1170名高风险个体（其中594人患癌）中进行，依据CT扫描确定的总腹部脂肪面积（TFA）进行分层。另外分析了278名患者的气道基因表达数据与TFA的关系，并考察了肥胖对化学物质和突变驱动的肺癌发生模型的影响。使用流式细胞术分析了小鼠肺部及患者支气管肺泡灌洗液（n=109）免疫环境的变化。结果：在单变量和多变量模型中，肺癌与较高的TFA有关。高TFA气道中的基因表达提示免疫活性受到抑制。

与瘦对照组相比，肥胖小鼠的肺部在基线和癌变过程中均显示出大量潜在抑制性髓系细胞、活化的调节性T细胞以及效应T细胞缺陷，而肥胖显著加剧了这一情况。功能测定和去除细胞研究表明，肥胖增强的Tregs能够促进肿瘤快速生长，对患者气道白细胞的流式分析进一步提示，高TFA患者的肺部免疫监视功能受损。结论：肥胖与肺癌发生增强相关。在临床和临床前系统中，免疫抑制机制随脂肪过多而上调，包括活化且功能性的Tregs。这些结果驳斥了肺癌风险存在肥胖悖论的观点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。