dCas9-KRAB CRISPRi 抑制 H1299 非小细胞肺癌细胞 TERT 的转录组数据
该数据集来自 NCBI GEO，针对 H1299 非小细胞肺癌细胞，通过 dCas9-KRAB CRISPRi 系统持续抑制端粒酶逆转录酶 TERT 表达，并开展 bulk RNA 测序以评估转录组范围的变化
基本信息
资源简介
dCas9-KRAB CRISPRi 抑制 H1299 非小细胞肺癌细胞 TERT 的转录组数据
dCas9-KRAB CRISPRi-mediated transcriptional repression of TERT in H1299 non-small cell lung cancer cells
该数据集来自 NCBI GEO，针对 H1299 非小细胞肺癌细胞，通过 dCas9-KRAB CRISPRi 系统持续抑制端粒酶逆转录酶 TERT 表达，并开展 bulk RNA 测序以评估转录组范围的变化。实验包含非靶向对照与靶向 TERT 启动子的 sgRNA 两组，转导后经嘌呤霉素筛选，于第 33 天收获样本，利用差异表达分析评估 TERT 抑制的特异性。数据可用于研究 TERT 转录抑制对肺癌细胞基因表达的影响及 CRISPRi 靶向特异性（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jun 24 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：对 H1299 非小细胞肺癌细胞中 dCas9-KRAB 介导的 CRISPR 干扰（CRISPRi）靶向端粒酶逆转录酶（TERT）所伴随的转录组范围变化，进行了 bulk RNA 测序评估。H1299 细胞被转导以共表达 dCas9-KRAB 及无引导 RNA（非靶向对照）或靶向 TERT 启动子的单向导 RNA 的慢病毒载体，经嘌呤霉素筛选，并在转导后第 33 天收获。采用差异表达分析评估持续 TERT 抑制的特异性。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336428
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 25 202，引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
采用bulk RNA测序评估H1299非小细胞肺癌细胞中dCas9-KRAB介导的端粒酶逆转录酶（TERT）CRISPR干扰（CRISPRi）相关的全转录组变化。将H1299细胞用共表达dCas9-KRAB及无向导RNA（非靶向对照）或靶向TERT启动子的单向导RNA的慢病毒载体转导，经嘌呤霉素筛选，并于转导后第33天收获。采用差异表达分析评估持续性TERT抑制的特异性。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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