Osimertinib处理PC9细胞特定细胞周期阶段的RNA-seq

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335846

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

奥希替尼是目前EGFR突变阳性晚期/转移性非小细胞肺癌（NSCLC）初治患者的标准治疗，然而耐药不可避免地会出现。即使在培养中，奥希替尼也无法根除所有癌细胞，会留下一个长期存在的药物耐受持留（DTP）细胞亚群，这一现象在许多化疗药物中普遍存在。DTP群体不增殖且看似处于休眠状态，但耐药克隆最终会从DTP状态中产生。本研究表明，在DTP状态下会发生广泛的DNA复制，细胞频繁地通过细胞周期进程，尽管细胞死亡也频繁发生，使得细胞分裂与细胞丢失达到平衡，群体数量大致保持恒定。细胞周期运行伴随着异常的基因表达和异常的DNA复制模式，导致DNA损伤、染色体外环状DNA形成和有丝分裂缺陷，使得正在复制的DTP细胞对低剂量的ATM和ATR抑制剂高度敏感。

我们的发现表明，DTP状态具有高度诱变性，而针对DTP细胞中的DNA修复进行干预，有可能通过阻止从头突变来防止耐药性的产生。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。