H3K36M 癌组蛋白抑制 NSD2 激活 SETD2 依赖的抗病毒样免疫反应（KRAS 驱动肺癌）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335211

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

组蛋白3第36位赖氨酸(H3K36)或其附近的突变通过限制H3K36导向的甲基转移酶，在多种肿瘤类型中具有显性致癌效应。与此相悖的是，我们发现H3K36M癌组蛋白的表达出乎意料地抑制了KRAS驱动的肺腺癌肿瘤形成，这是通过诱导强大的免疫介导的肿瘤清除实现的。在机制上，癌组蛋白的表达去抑制内源性逆转录病毒元件的转录，导致双链RNA(dsRNA)的积累，并激活一种先天抗病毒样免疫反应，从而根除肿瘤生长。令人惊讶的是，虽然H3K36二甲基转移酶NSD2的失活复制了癌组蛋白表达的所有效应，但H3K36三甲基转移酶SETD2的失活则废除了元件去抑制以及由癌组蛋白表达所诱导的所有相关下游抗癌效应。这些观察结果重构了我们对H3K36甲基化作用、其在癌症中失调后果的理解，并塑造了我们对靶向H3K36甲基转移酶治疗干预的预期。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。