肺癌中细胞毒性CD39+肿瘤相关NK细胞对NKG2A阻断的响应
该数据集来自NCBI GEO,标题为细胞毒性CD39+肿瘤相关NK细胞对NKG2A阻断在肺癌中的响应。可用于研究肺癌肿瘤微环境中CD39阳性NK细胞的细胞毒性功能及其对NKG2A免疫检查点阻断的反应,为肺癌免疫治疗机制探索提供转录组或结合谱层面的数据支持(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
肺癌中细胞毒性CD39+肿瘤相关NK细胞对NKG2A阻断的响应
GSE334763 是一个来自 NCBI GEO 的肿瘤相关数据集,英文标题为“Cytotoxic CD39+ tumor-associated NK cells respond to NKG2A blockade in lung cancer”,中文可译为“细胞毒性 CD39+ 肿瘤相关 NK 细胞对肺癌中 NKG2A 阻断的响应”。该数据集归属于肿瘤 / 肺癌分类,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,由 DBM Bioinformatics 与 Core Facility 提交,发布时间为 Jun 08 202。数据集共包含 1 个文件,文件样例为 GSE334763_series_matrix.txt.gz。整体来看,该数据集围绕肺癌肿瘤微环境中 CD39 阳性自然杀伤(NK)细胞的细胞毒性功能及其对 NKG2A 免疫检查点阻断的反应展开,可为肺癌免疫治疗机制研究提供转录组或结合谱层面的数据支持。
【数据集背景】
该数据集的主题聚焦于肺癌中细胞毒性 CD39+ 肿瘤相关 NK 细胞对 NKG2A 阻断的响应。NK 细胞是免疫系统中具有直接杀伤肿瘤细胞能力的重要细胞类型,而肿瘤微环境中的 NK 细胞常出现功能受抑或表型改变。CD39 是一种与免疫调节相关的表面标志物,在肿瘤相关免疫细胞中可能具有特定意义。NKG2A 则是一种抑制性受体,其阻断策略属于免疫检查点治疗的研究方向之一。该数据集旨在从高通量测序层面刻画 CD39+ 肿瘤相关 NK 细胞在 NKG2A 阻断条件下的特征,为理解肺癌免疫微环境中的 NK 细胞应答提供数据基础。源站标题与数据集英文名一致,均强调“细胞毒性 CD39+ 肿瘤相关 NK 细胞”与“NKG2A 阻断”在肺癌背景下的关联。
【数据内容】
该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE334763_series_matrix.txt.gz。源站描述指出,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成。主题标签包括“Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing”、GPL24676 以及 9606。其中 9606 对应人类物种,GPL24676 为平台标识,表明数据基于高通量测序技术产生,并涉及基因组结合或占据谱分析。文件样例名称中的“series_matrix”通常表示该文件以矩阵形式组织样本与特征信息,适合用于查看样本分组、表达或结合信号等结构化数据。由于文件数量仅为 1,该数据集可能以整合后的矩阵文件作为主要数据载体,具体包含的样本数量、分组方式、检测基因或结合位点数量等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI GEO,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。提交者为 DBM Bioinformatics 与 Core Facility,发布时间为 Jun 08 202。数据集英文名与源站标题一致,均为“Cytotoxic CD39+ tumor-associated NK cells respond to NKG2A blockade in lung cancer”。主题标签中的 GPL24676 和 9606 分别指向特定测序平台与人类物种,说明数据采集自人类肺癌相关样本,并采用高通量测序方法进行基因组结合或占据谱分析。关于样本的具体来源组织、患者信息、实验处理条件、测序深度、生物学重复数量等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于研究肺癌肿瘤微环境中 CD39 阳性 NK 细胞的细胞毒性功能及其对 NKG2A 免疫检查点阻断的反应。具体而言,适合开展以下方向的分析:NK 细胞在肺癌中的转录组或结合谱特征;CD39 作为肿瘤相关 NK 细胞标志物的潜在作用;NKG2A 阻断前后 NK 细胞功能相关基因或结合区域的变化;肺癌免疫治疗机制中 NK 细胞应答的探索。由于主题标签涉及“Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing”,该数据也可能适用于分析蛋白质与基因组结合位点的占据情况,例如转录因子或染色质相关蛋白在 NK 细胞中的结合谱。该数据集可为肺癌免疫治疗的基础研究提供数据支持,尤其适用于关注 NK 细胞检查点阻断的科研场景。
【使用方法】
使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE334763_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,需按 GZIP 压缩包进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。由于文件为 series_matrix 格式,通常可使用常规文本处理工具或生物信息学分析流程读取,解析样本信息、特征标识及对应的信号值。在批量分析前,应检查样本分组、平台注释、基因或结合区域标识是否完整,并确认数据矩阵的维度与预期一致。若后续需要结合 GPL24676 平台注释进行基因或基因组区域映射,可依据平台标识获取相应注释信息。具体分析流程应根据研究目的设计,例如差异分析、功能富集或结合峰注释等。源站未提供更详细的使用说明或分析脚本。
【质量与限制】
该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE334763_series_matrix.txt.gz,源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成。关于数据质量、测序深度、重复性、批次效应、样本量、临床信息、处理组与对照组设置等,源站未提供。主题标签中的 GPL24676 和 9606 提供了平台与物种信息,但未说明具体实验设计细节。因此,在使用该数据集时,需注意其可能存在的限制,例如无法从现有信息判断样本异质性、数据覆盖度或统计效力。此外,该数据集为 SuperSeries,可能包含多个 SubSeries,但具体子系列内容、文件组织方式及数据完整性,源站未提供。使用者应自行评估数据是否满足其研究需求,并在分析中谨慎解释结果。
【引用与许可】
该数据集的作者为 DBM Bioinformatics 与 Core Facility,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 Jun 08 202。关于引用方式、许可协议、使用限制或版权声明,源站未提供。使用者在使用该数据集时,应遵循 NCBI GEO 的通用使用规范,并建议在相关出版物中引用该数据集的 GEO 登录号 GSE334763 及源站标题。若需了解具体的引用要求或许可条款,应查阅 NCBI GEO 官方页面或联系数据提交者。源站未提供明确的许可信息,因此无法确认是否允许商业使用或再分发。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE334763
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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