肺癌中细胞毒性CD39+肿瘤相关NK细胞对NKG2A阻断的响应

该数据集来自NCBI GEO,标题为细胞毒性CD39+肿瘤相关NK细胞对NKG2A阻断在肺癌中的响应。可用于研究肺癌肿瘤微环境中CD39阳性NK细胞的细胞毒性功能及其对NKG2A免疫检查点阻断的反应,为肺癌免疫治疗机制探索提供转录组或结合谱层面的数据支持(来源 NCBI)

geo
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时间序列分类GPL246769606
GSE334763: Cytotoxic CD39+ tumor-associated NK cells respond to NKG2A blockade in lung cancer

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

肺癌中细胞毒性CD39+肿瘤相关NK细胞对NKG2A阻断的响应

GSE334763 是一个来自 NCBI GEO 的肿瘤相关数据集,英文标题为“Cytotoxic CD39+ tumor-associated NK cells respond to NKG2A blockade in lung cancer”,中文可译为“细胞毒性 CD39+ 肿瘤相关 NK 细胞对肺癌中 NKG2A 阻断的响应”。该数据集归属于肿瘤 / 肺癌分类,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,由 DBM Bioinformatics 与 Core Facility 提交,发布时间为 Jun 08 202。数据集共包含 1 个文件,文件样例为 GSE334763_series_matrix.txt.gz。整体来看,该数据集围绕肺癌肿瘤微环境中 CD39 阳性自然杀伤(NK)细胞的细胞毒性功能及其对 NKG2A 免疫检查点阻断的反应展开,可为肺癌免疫治疗机制研究提供转录组或结合谱层面的数据支持。

【数据集背景】

该数据集的主题聚焦于肺癌中细胞毒性 CD39+ 肿瘤相关 NK 细胞对 NKG2A 阻断的响应。NK 细胞是免疫系统中具有直接杀伤肿瘤细胞能力的重要细胞类型,而肿瘤微环境中的 NK 细胞常出现功能受抑或表型改变。CD39 是一种与免疫调节相关的表面标志物,在肿瘤相关免疫细胞中可能具有特定意义。NKG2A 则是一种抑制性受体,其阻断策略属于免疫检查点治疗的研究方向之一。该数据集旨在从高通量测序层面刻画 CD39+ 肿瘤相关 NK 细胞在 NKG2A 阻断条件下的特征,为理解肺癌免疫微环境中的 NK 细胞应答提供数据基础。源站标题与数据集英文名一致,均强调“细胞毒性 CD39+ 肿瘤相关 NK 细胞”与“NKG2A 阻断”在肺癌背景下的关联。

【数据内容】

该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE334763_series_matrix.txt.gz。源站描述指出,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成。主题标签包括“Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing”、GPL24676 以及 9606。其中 9606 对应人类物种,GPL24676 为平台标识,表明数据基于高通量测序技术产生,并涉及基因组结合或占据谱分析。文件样例名称中的“series_matrix”通常表示该文件以矩阵形式组织样本与特征信息,适合用于查看样本分组、表达或结合信号等结构化数据。由于文件数量仅为 1,该数据集可能以整合后的矩阵文件作为主要数据载体,具体包含的样本数量、分组方式、检测基因或结合位点数量等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。提交者为 DBM Bioinformatics 与 Core Facility,发布时间为 Jun 08 202。数据集英文名与源站标题一致,均为“Cytotoxic CD39+ tumor-associated NK cells respond to NKG2A blockade in lung cancer”。主题标签中的 GPL24676 和 9606 分别指向特定测序平台与人类物种,说明数据采集自人类肺癌相关样本,并采用高通量测序方法进行基因组结合或占据谱分析。关于样本的具体来源组织、患者信息、实验处理条件、测序深度、生物学重复数量等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究肺癌肿瘤微环境中 CD39 阳性 NK 细胞的细胞毒性功能及其对 NKG2A 免疫检查点阻断的反应。具体而言,适合开展以下方向的分析:NK 细胞在肺癌中的转录组或结合谱特征;CD39 作为肿瘤相关 NK 细胞标志物的潜在作用;NKG2A 阻断前后 NK 细胞功能相关基因或结合区域的变化;肺癌免疫治疗机制中 NK 细胞应答的探索。由于主题标签涉及“Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing”,该数据也可能适用于分析蛋白质与基因组结合位点的占据情况,例如转录因子或染色质相关蛋白在 NK 细胞中的结合谱。该数据集可为肺癌免疫治疗的基础研究提供数据支持,尤其适用于关注 NK 细胞检查点阻断的科研场景。

【使用方法】

使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE334763_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,需按 GZIP 压缩包进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。由于文件为 series_matrix 格式,通常可使用常规文本处理工具或生物信息学分析流程读取,解析样本信息、特征标识及对应的信号值。在批量分析前,应检查样本分组、平台注释、基因或结合区域标识是否完整,并确认数据矩阵的维度与预期一致。若后续需要结合 GPL24676 平台注释进行基因或基因组区域映射,可依据平台标识获取相应注释信息。具体分析流程应根据研究目的设计,例如差异分析、功能富集或结合峰注释等。源站未提供更详细的使用说明或分析脚本。

【质量与限制】

该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE334763_series_matrix.txt.gz,源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成。关于数据质量、测序深度、重复性、批次效应、样本量、临床信息、处理组与对照组设置等,源站未提供。主题标签中的 GPL24676 和 9606 提供了平台与物种信息,但未说明具体实验设计细节。因此,在使用该数据集时,需注意其可能存在的限制,例如无法从现有信息判断样本异质性、数据覆盖度或统计效力。此外,该数据集为 SuperSeries,可能包含多个 SubSeries,但具体子系列内容、文件组织方式及数据完整性,源站未提供。使用者应自行评估数据是否满足其研究需求,并在分析中谨慎解释结果。

【引用与许可】

该数据集的作者为 DBM Bioinformatics 与 Core Facility,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 Jun 08 202。关于引用方式、许可协议、使用限制或版权声明,源站未提供。使用者在使用该数据集时,应遵循 NCBI GEO 的通用使用规范,并建议在相关出版物中引用该数据集的 GEO 登录号 GSE334763 及源站标题。若需了解具体的引用要求或许可条款,应查阅 NCBI GEO 官方页面或联系数据提交者。源站未提供明确的许可信息,因此无法确认是否允许商业使用或再分发。

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使用方式

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE334763

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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