GKB202处理肺癌与胰腺癌循环肿瘤细胞的转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE333988

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

循环肿瘤细胞（CTCs）与癌症的转移扩散和适应性应激反应相关。在本研究中，从肺癌和胰腺癌样本中分离出的患者来源CTCs经GKB202处理，以探究治疗相关的转录组变化。GKB202是一种源自牛樟芝的天然化合物。研究采用bulk RNA测序比较未处理/对照与GKB202处理的CTC样本。该数据集提供了原始测序reads和经处理的基因水平表达矩阵，可用于评估GKB202对CTC相关转录程序（包括应激反应和癌症相关通路）的影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。