肿瘤引流淋巴结中PLA2G2D调控抗肿瘤免疫

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE333464

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目前的癌症免疫疗法可以诱导肿瘤消退，尽管疗效往往不持久。近期研究强调了从肿瘤引流淋巴结（TDLNs）中建立系统性免疫反应的重要性。然而，驱动TDLNs中免疫抑制的机制仍研究不足。我们对黑色素瘤TDLNs应用了空间蛋白质基因组学，并识别出在长期（>5年）疾病控制患者与早期（<2年）疾病复发患者的淋巴结中，免疫细胞组成的区域差异。预后不良患者的TDLNs特征为调节性T细胞（Tregs）、树突状细胞（DCs）和巨噬细胞扩增，并与细胞毒性CD8+ T细胞相互作用。对该空间邻域内细胞类型的靶向转录组学分析揭示了与趋于耗竭的CD8+ T细胞相互作用的免疫调节性髓系细胞表型。除了已知的免疫抑制分子如IDO和PD-L1外，复发疾病患者的副皮质巨噬细胞和DCs在不同癌症类型中均高表达分泌型磷脂酶PLA2G2D。

此外，在对抗PD-1免疫治疗产生获得性耐药的非小细胞肺癌患者中，PLA2G2D表达上调。重要的是，PLA2G2D功能缺失或治疗性抑制显著提高了荷瘤小鼠的生存率，并增强了抗PD-1免疫治疗的疗效。综上所述，我们对癌症患者TDLN进行的深入空间 profiling 提供了对系统性抗肿瘤免疫的新见解，并确定了PLA2G2D作为癌症免疫治疗的靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。