AXL 磷酸化位点图谱关联 FAK1 与 YAP1 信号介导 EGFR 突变肺癌厄洛替尼耐药

研究通过构建在 AXL 每个胞内酪氨酸残基上引入苯丙氨酸替换的 PC9 肺腺癌细胞系,整合磷酸化数据与表型变化进行多变量建模,发现 AXL 信号分为两个富集 Abl1 和 SFK 底物基序的簇,并通过肽特异性筛选将 FAK1 鉴定为 AXL 的近端底物,AXL 介导的 YAP1 激活维持药物耐受

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时间序列分类GPL246769606
GSE333379: AXL phosphosite mapping links FAK1 and YAP1 signaling to erlotinib resistance in EGFR-mutant lung cancer

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

AXL 磷酸化位点图谱关联 FAK1 与 YAP1 信号介导 EGFR 突变肺癌厄洛替尼耐药

AXL phosphosite mapping links FAK1 and YAP1 signaling to erlotinib resistance in EGFR-mutant lung cancer

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 AXL phosphosite mapping links FAK1 and YAP1 signaling to erlotinib resistance in EGFR-mutant lung cancer,属于肿瘤/肺癌方向。研究通过构建在 AXL 每个胞内酪氨酸残基上引入苯丙氨酸替换的 PC9 肺腺癌细胞系,整合磷酸化数据与表型变化进行多变量建模,发现 AXL 信号分为两个富集 Abl1 和 SFK 底物基序的簇,并通过肽特异性筛选将 FAK1 鉴定为 AXL 的近端底物,AXL 介导的 YAP1 激活维持药物耐受。数据可用于研究 EGFR 突变肺癌的 erlotinib 耐药机制与信号。

【数据集背景】

源站首次发布:May 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):受体酪氨酸激酶的靶向治疗有效,但不可避免地受到耐药性的限制。在 EGFR 突变肺癌中,AXL 激活通过恢复细胞存活和迁移驱动对 erlotinib 的耐药。为绘制这些信号机制,我们构建了一组肺腺癌 PC9 细胞系,在每个胞内 AXL 酪氨酸残基上引入苯丙氨酸替换。通过多变量建模将磷酸化数据与表型变化整合,我们发现 AXL 信号组织为两个簇,分别富集 Abl1 和 SFK 底物基序。一项肽特异性筛选将 FAK1 鉴定为 AXL 的近端底物之一。在下游,AXL 介导的 YAP1 激活被发现维持药物耐受,而联合抑制在体外清除了持留细胞。这些 AXL 和 YAP 通路与 erloti 中的疾病进展和不良临床结局相关。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE333379

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 26 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

受体酪氨酸激酶的靶向治疗有效,但不可避免地受限于耐药性。在EGFR突变型肺癌中,AXL激活通过恢复细胞存活和迁移驱动对厄洛替尼的耐药。为绘制这些信号机制,我们构建了一组肺腺癌PC9细胞系,在每个细胞内AXL酪氨酸残基上进行了苯丙氨酸替换。通过多变量建模将磷酸化数据与表型变化整合,我们发现AXL信号组织成两个簇,分别富集Abl1和SFK底物基序。肽特异性筛选确定FAK1为AXL的主要近端底物。在下游,发现AXL介导的YAP1激活维持药物耐受,而联合抑制在体外消除了持留细胞。这些AXL和YAP通路与厄洛替尼治疗患者的疾病进展和不良临床结局相关。总之,本研究剖析了AXL驱动厄洛替尼耐药的具体信号调控因子。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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