EZH1/2抑制通过MHC II类去抑制和中性粒细胞重编程改善免疫治疗反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330733

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数据说明

肺鳞状细胞癌是一种难以治疗的癌症，在美国尤其是肯塔基州发病率很高。本研究的目标是检验EZH1/2抑制剂valemetostat是否能改善肺鳞状细胞癌模型中的抗PD1反应，并开发离体模型以测试免疫治疗药物组合。我们发现，valemetostat通过上调肿瘤细胞特异性主要组织相容性复合体II类（MHC II类）分子以及向活化CD8+ T细胞的转变，增强了对anti-PD1治疗的抗肿瘤反应。无论采用何种治疗，中性粒细胞在这些肿瘤中均占主导地位，但骨髓检查显示，valemetostat处理的小鼠和排斥肿瘤的小鼠均具有更多成熟中性粒细胞。同样，Ezh2敲除小鼠产生的中性粒细胞凋亡更多、迁移能力更弱、产生胞外网的能力更低，但杀灭细菌的能力与Ezh2-WT中性粒细胞相似。

为测试肿瘤对不同中性粒细胞群体的反应，我们构建了三维气液界面培养物，其中包含肿瘤类器官、肺间充质细胞和T细胞，并分别添加或不添加来自不同供体的含有中性粒细胞和髓系祖细胞的骨髓。来自未接触肿瘤小鼠和肿瘤活跃生长且未经治疗小鼠的骨髓促进了肿瘤类器官生长，而来自肿瘤被排斥小鼠和经valemetostat治疗肿瘤小鼠的骨髓则具有抗肿瘤作用。MHC II类分子阻断降低了骨髓促进肿瘤生长的能力，并削弱了valemetostat联合抗PD1减少肿瘤类器官生长的能力。患者样本显示EZH2与MHC II类分子之间存在强烈的负相关，提示靶向EZH2活性可能导致MHC II类分子显著增加，并改善肺鳞状细胞癌的治疗反应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。