持续性TOP1切割复合物驱动肺癌EGFR靶向治疗适应性耐药

该数据集来自NCBI,聚焦EGFR突变肺癌对靶向治疗产生适应性耐药的机制。研究显示EGFR抑制会短暂下调TDP1,导致TOP1cc积累,促进耐药突变获得与细胞再增殖,并发现约25%的EGFR突变肺癌缺乏TDP1表达

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基因组分类GPL246769606
GSE330247: Persistent TOP1 cleavage complexes drive adaptive resistance to EGFR-targeted therapies in lung cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

持续性TOP1切割复合物驱动肺癌EGFR靶向治疗适应性耐药

Persistent TOP1 cleavage complexes drive adaptive resistance to EGFR-targeted therapies in lung cancer

该数据集来自NCBI,聚焦EGFR突变肺癌对靶向治疗产生适应性耐药的机制。研究显示EGFR抑制会短暂下调TDP1,导致TOP1cc积累,促进耐药突变获得与细胞再增殖,并发现约25%的EGFR突变肺癌缺乏TDP1表达。数据包含1个文件,为高通量测序表达谱,可用于分析耐药相关基因表达变化及TDP1缺失背景下的转录特征(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 07 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):靶向癌症治疗的耐药性常源于药物耐受细胞(DTCs),它们通过进入非增殖状态在治疗中存活。随着时间推移,DTCs可获得突变,从而促进细胞再增殖,但非增殖的DTCs如何积累此类突变仍不清楚。在此,我们表明,在EGFR突变的肺癌中,EGFR抑制会短暂下调酪氨酰-DNA磷酸二酯酶1(TDP1),这是一种修复酶,可解决流产型拓扑异构酶I切割复合物(TOP1ccs)。在DTCs中,升高的活性氧促进TOP1cc捕获,而TDP1下调损害其修复,驱动TOP1cc积累、耐药突变获得和细胞再增殖。我们进一步发现,在约25%的EGFR突变肺癌中TDP1表达缺失。在TDP1缺陷细胞中,将EGFR抑制与亚致死浓度的

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330247

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 22 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

靶向癌症治疗的耐药性常源于药物耐受细胞(DTCs),这些细胞通过进入非增殖状态在治疗中存活。随着时间推移,DTCs可获得促进细胞再增殖的突变,但非增殖的DTCs如何积累此类突变仍不清楚。在此,我们展示在EGFR突变的肺癌中,EGFR抑制会短暂下调酪氨酰-DNA磷酸二酯酶1(TDP1),这是一种修复酶,可解决失败拓扑异构酶I切割复合物(TOP1ccs)。在DTCs中,升高的活性氧促进TOP1cc捕获,而TDP1下调则损害其修复,驱动TOP1cc积累、耐药突变获得和细胞再增殖。我们进一步发现,在大约25%的EGFR突变肺癌中,TDP1表达缺失。在TDP1缺陷细胞中,将EGFR抑制与亚致死浓度的拓扑替康(topotecan)联合使用,后者进一步增加TOP1ccs,可消除细胞再增殖。

总之,这些发现表明TOP1cc积累是一种将药物耐受性与驱动适应性耐药的诱变程序联系起来的机制,并揭示了TDP1缺失是EGFR突变肺癌中的一个可靶向弱点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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