EZH2 抑制重塑 3D 染色质结构诱导小细胞肺癌免疫原性表型 [microC]

该数据集为 Micro-C 测序数据,来自神经内分泌小细胞肺癌细胞系 NCI-H146,经双重 EZH1/2 抑制剂 valemetostat 处理 9 天,用于高分辨率 3D 基因组图谱构建

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基因组分类OtherGPL246769606
GSE329206: EZH2 inhibition reshapes 3D chromatin architecture to induce immunogenic phenotype in small cell lung cancer [microC]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

EZH2 抑制重塑 3D 染色质结构诱导小细胞肺癌免疫原性表型 [microC]

EZH2 inhibition reshapes 3D chromatin architecture to induce immunogenic phenotype in small cell lung cancer [microC]

该数据集为 Micro-C 测序数据,来自神经内分泌小细胞肺癌细胞系 NCI-H146,经双重 EZH1/2 抑制剂 valemetostat 处理 9 天,用于高分辨率 3D 基因组图谱构建。研究结合 Micro-C、ATAC-seq 与 RNA-seq 多组学分析,探究 EZH1/2 抑制如何重塑 3D 染色质景观及其与转录调控的关系。数据可用于研究 EZH2 介导的表观遗传沉默机制、染色质构象变化与免疫及 DNA 修复基因表达调控,适用于小细胞肺癌表观遗传与免疫原性相关分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):EZH2 是 Polycomb 抑制复合物 2(PRC2)的酶核心,在小细胞肺癌(SCLC)中过表达。既往研究表明,EZH2 强制沉默免疫和 DNA 修复基因的表观遗传,包括 I 类 MHC 分子(HLA-A/B/C)和 SLFN11。为研究 EZH1/2 抑制如何重塑 3D 染色质景观及其与转录调控的关系,我们对经双重 EZH1/2 抑制剂 valemetostat 处理 9 天的神经内分泌 SCLC 细胞系(NCI-H146)进行了多组学分析。我们采用 Micro-C 测序进行高分辨率 3D 基因组图谱构建,ATAC 测序进行染色质可及性分析,RNA 测序进行全转录组分析。这是 Micro-C 测序数据集。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Other、GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329206

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 28 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

EZH2是Polycomb抑制复合物2(PRC2)的酶催化核心,在小细胞肺癌(SCLC)中过表达。既往研究表明,EZH2可强制介导免疫基因和DNA修复基因的表观遗传沉默,包括I类MHC分子(HLA-A/B/C)和SLFN11。为探究EZH1/2抑制如何重塑三维染色质景观及其与转录调控的关系,我们对经双重EZH1/2抑制剂valemetostat处理9天的神经内分泌SCLC细胞系(NCI-H146)进行了多组学分析。我们采用Micro-C测序进行高分辨率三维基因组图谱绘制,采用ATAC测序进行染色质可及性分析,并采用RNA测序进行全转录组分析。本数据集为Micro-C测序数据集。

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