EZH2 抑制重塑 3D 染色质结构诱导小细胞肺癌免疫原性表型 [RNA-Seq]
该数据集为小细胞肺癌(SCLC)神经内分泌细胞系 NCI-H146 经双重 EZH1/2 抑制剂 valemetostat 处理 9 天后的 RNA 测序数据,属于多组学分析中的转录组部分
![GSE329205: EZH2 inhibition reshapes 3D chromatin architecture to induce immunogenic phenotype in small cell lung cancer [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/74521.jpg)
基本信息
资源简介
EZH2 抑制重塑 3D 染色质结构诱导小细胞肺癌免疫原性表型 [RNA-Seq]
EZH2 inhibition reshapes 3D chromatin architecture to induce immunogenic phenotype in small cell lung cancer [RNA-Seq]
该数据集为小细胞肺癌(SCLC)神经内分泌细胞系 NCI-H146 经双重 EZH1/2 抑制剂 valemetostat 处理 9 天后的 RNA 测序数据,属于多组学分析中的转录组部分。研究旨在探究 EZH1/2 抑制如何重塑 3D 染色质景观及其与转录调控的关系,配套还包括 Micro-C 与 ATAC-seq 数据。本 RNA-Seq 数据可用于分析 EZH2 抑制后全转录组表达变化,识别免疫相关基因及 DNA 修复基因(如 Class I MHC、SLFN11)的再激活,为研究表观遗传药物诱导 SCLC 免疫原性表型的机制提供转录层面依据(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 27 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):EZH2 是 Polycomb 抑制复合物 2(PRC2)的酶核心,在小细胞肺癌(SCLC)中过表达。既往研究表明,EZH2 强制表观遗传沉默免疫和 DNA 修复基因,包括 I 类 MHC 分子(HLA-A/B/C)和 SLFN11。为研究 EZH1/2 抑制如何重塑 3D 染色质景观及其与转录调控的关系,我们对经双重 EZH1/2 抑制剂 valemetostat 处理 9 天的神经内分泌 SCLC 细胞系(NCI-H146)进行了多组学分析。我们采用 Micro-C 测序进行高分辨率 3D 基因组图谱绘制,ATAC 测序进行染色质可及性分析,RNA 测序进行全转录组分析。这是 RNA 测序数据集。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329205
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- OpenDataLab:
数据说明
EZH2是Polycomb抑制复合物2(PRC2)的酶催化核心,在小细胞肺癌(SCLC)中过表达。既往研究表明,EZH2可强制介导免疫基因和DNA修复基因的表观遗传沉默,包括I类MHC分子(HLA-A/B/C)和SLFN11。为探究EZH1/2抑制如何重塑三维染色质景观及其与转录调控的关系,我们对经双重EZH1/2抑制剂valemetostat处理9天的神经内分泌SCLC细胞系(NCI-H146)进行了多组学分析。我们采用Micro-C测序进行高分辨率三维基因组图谱绘制,ATAC测序进行染色质可及性分析,RNA测序进行全转录组分析。本数据集为RNA测序数据。
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