EZH2 抑制重塑 3D 染色质结构诱导小细胞肺癌免疫原性表型 [ATAC-Seq]
该数据集为小细胞肺癌(SCLC)研究中 EZH2 抑制相关多组学分析中的 ATAC 测序部分,针对神经内分泌 SCLC 细胞系 NCI-H146,使用双重 EZH1/2 抑制剂 valemetostat 处理 9 天,通过 ATAC-sequencing 进行染色质可及性分析,用于探究 EZH1/2
![GSE329204: EZH2 inhibition reshapes 3D chromatin architecture to induce immunogenic phenotype in small cell lung cancer [ATAC-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/75427.jpg)
基本信息
资源简介
EZH2 抑制重塑 3D 染色质结构诱导小细胞肺癌免疫原性表型 [ATAC-Seq]
EZH2 inhibition reshapes 3D chromatin architecture to induce immunogenic phenotype in small cell lung cancer [ATAC-Seq]
该数据集为小细胞肺癌(SCLC)研究中 EZH2 抑制相关多组学分析中的 ATAC 测序部分,针对神经内分泌 SCLC 细胞系 NCI-H146,使用双重 EZH1/2 抑制剂 valemetostat 处理 9 天,通过 ATAC-sequencing 进行染色质可及性分析,用于探究 EZH1/2 抑制如何重塑 3D 染色质景观及其与转录调控的关系。数据包含 1 个文件,可用于研究染色质开放状态变化与免疫相关基因表达调控的关联(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 27 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):EZH2 是 Polycomb 抑制复合物 2(PRC2)的酶核心,在小细胞肺癌(SCLC)中过表达。既往研究表明,EZH2 强制对免疫和 DNA 修复基因进行表观遗传沉默,包括 I 类 MHC 分子(HLA‑A/B/C)和 SLFN11。为研究 EZH1/2 抑制如何重塑 3D 染色质景观及其与转录调控的关系,我们对神经内分泌 SCLC 细胞系(NCI‑H146)使用双重 EZH1/2 抑制剂 valemetostat 处理 9 天,并进行了多组学分析。我们采用 Micro‑C 测序进行高分辨率 3D 基因组图谱绘制,ATAC 测序进行染色质可及性分析,RNA 测序进行全转录组分析。这是 ATAC 测序数据集。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329204
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 28 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
EZH2是Polycomb抑制复合物2(PRC2)的酶催化核心,在小细胞肺癌(SCLC)中过表达。既往研究表明,EZH2可强制介导免疫基因和DNA修复基因的表观遗传沉默,包括I类MHC分子(HLA-A/B/C)和SLFN11。为探究EZH1/2抑制如何重塑三维染色质景观及其与转录调控的关系,我们对经双重EZH1/2抑制剂valemetostat处理9天的神经内分泌SCLC细胞系(NCI-H146)进行了多组学分析。我们采用Micro-C测序进行高分辨率三维基因组图谱绘制,采用ATAC测序进行染色质可及性分析,并采用RNA测序进行全转录组分析。本数据集为ATAC测序数据集。
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