非小细胞肺癌脑转移组织、脑脊液与血浆的甲基化图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327701

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目研究非小细胞肺癌（NSCLC）脑转移患者肿瘤、脑脊液（CSF）和血液中的全基因组DNA甲基化模式。作为常规临床诊疗的一部分，在神经外科切除时获取的脑转移肿瘤组织与同一患者同一时间采集的脑脊液和血浆游离DNA（cfDNA）一同进行了分析。此外，还分析了在临床怀疑软脑膜转移时采集的纵向脑脊液和血浆cfDNA样本。所有样本均使用PredicineEPIC全基因组甲基化分析平台进行评估，以识别差异甲基化片段（DMF）覆盖的CpG位点。这些数据支持液体活检方法的发展，用于NSCLC脑转移患者中枢神经系统疾病的检测、监测和风险分层。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。