GSE327213：mRNA翻译增强延缓肺癌肿瘤起始并暴露治疗脆弱性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327213

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管蛋白质合成抑制剂正被评估作为抗癌药物，但早期肿瘤发生中mRNA翻译的动态变化仍知之甚少。我们报道，在早期KRAS驱动的肺腺癌中，mRNA翻译抑制因子eIF4A2的缺失会导致蛋白质合成格局失调，其特征为分泌组强烈上调、分泌区室增大、氧化代谢增强以及获得衰老样特征。矛盾的是，这种过度驱动的蛋白质合成格局延缓了肿瘤发生，并导致肺部出现非增殖性、p21阳性KRAS表达细胞簇。给予雷帕霉素以降低mRNA翻译，可抑制衰老并在eIF4A2缺失后恢复肿瘤发生。重要的是，一些eIF4A2缺失细胞克服衰老，形成侵袭性生长的肿瘤。通过多重成像和空间转录组学相结合对这些eIF4A2缺失肿瘤的分析表明，KRAS下游通路通过MAP激酶增强和PI3K信号减弱而发生重连。

因此，与eIF4A2阳性病变不同，这些肿瘤可能通过给予MEK抑制剂而被消除。这样一来，mRNA翻译失调迫使癌细胞依赖MEK信号传导，从而暴露了KRAS驱动肺腺癌的一个潜在治疗弱点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。