GSE327192：树突状细胞介导的抗原呈递调控癌症中三级淋巴结构发育 [MERFISH]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327192

标准获取流程：

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数据说明

三级淋巴结构（TLS）与免疫治疗的有利应答相关，但其在肿瘤中形成和维持的机制仍不明确。通过对人类肿瘤进行高分辨率空间映射，我们发现在TLS内CCR7⁺成熟树突状细胞（DC）的一致性积聚。为剖析其功能，我们开发了一种非小细胞肺癌（NSCLC）模型，该模型可重现成熟TLS的形成。利用该模型，我们证明TLS的诱导需要IFNγ驱动的1型经典树突状细胞（cDC1）成熟、其向肿瘤引流淋巴结（tdLN）的迁移，以及随后tdLN致敏T细胞向肿瘤微环境的募集。随着肿瘤进展，即使缺乏tdLN T细胞流出，TLS仍持续存在，同时伴有cDC1向tdLN迁移受损及其滞留于富含CCR7配体的瘤内基质枢纽中。定时清除cDC1或阻断其向这些枢纽的定位会破坏TLS的维持。

引人注目的是，cDC1上MHC I类和II类的同步基因敲除消除了TLS的维持、滤泡辅助性T（TFH）细胞、生发中心形成、肿瘤特异性IgG产生以及祖细胞耗竭CD8⁺ T细胞的分化。这些发现确立了局部cDC1介导的向CD8⁺和CD4⁺ T细胞呈递抗原是抗肿瘤TLS程序的核心协调者，并成为治疗干预的有力靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。