肝脏特异性Sirt1敲除小鼠肺组织微阵列分析

该数据集来自 NCBI GEO,标题为肝脏特异性 Sirt1 敲除小鼠肺组织的微阵列分析,用于探究肝脏特异性 Sirt1 敲除小鼠的病理特征

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL1946210090
GSE326924: Microarray analysis of liver-specific  Sirt1 knockout mice lung tissue

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

肝脏特异性Sirt1敲除小鼠肺组织微阵列分析

该数据集来自 NCBI GEO,英文名称为 GSE326924: Microarray analysis of liver-specific Sirt1 knockout mice lung tissue,源站标题与英文名称一致,中文可理解为“肝脏特异性 Sirt1 敲除小鼠肺组织的微阵列分析”。数据集在本站被归类为肿瘤 / 肺癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。其核心用途是围绕肝脏特异性 Sirt1 敲除小鼠的病理特征展开研究,通过微阵列表达谱分析肺组织样本,为理解该基因敲除模型下的肺部分子变化提供数据基础。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE326924_series_matrix.txt.gz,作者为 Yiwei,CAO,发布时间为 Apr 03 202,主题标签包括 Expression profiling by array、GPL19462 和 10090。

【数据集背景】

该数据集的研究背景聚焦于肝脏特异性 Sirt1 敲除小鼠。Sirt1 是与细胞代谢、应激反应和衰老等过程相关的基因,而肝脏特异性敲除意味着该基因的缺失被限定在肝脏组织中。源站描述指出,研究的目的是探究肝脏特异性 Sirt1 敲除小鼠的病理特征。由于数据集标题明确指向肺组织的微阵列分析,可以判断该研究关注的是肝脏中 Sirt1 缺失后,肺组织是否出现可检测的表达谱改变,以及这些改变与病理表现之间的潜在联系。本站将其归入肿瘤 / 肺癌分类,说明该数据集可能被用于肺癌或肿瘤相关研究场景中,作为探索基因敲除模型与肺部病变关系的表达谱资源。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE326924_series_matrix.txt.gz。该文件是 GZIP 压缩包,属于微阵列表达谱数据常见的系列矩阵文件格式。主题标签中的 Expression profiling by array 表明数据通过微阵列芯片技术产生,GPL19462 为平台标识,10090 为小鼠的分类学编号,说明样本来自小鼠。源站未提供样本数量、分组设计、具体基因表达值、差异表达分析结果等细节。因此,关于数据内容的具体维度、字段结构和生物学结论,源站未提供。

【采集与来源】

数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI GEO 公共数据库。作者为 Yiwei,CAO,发布时间为 Apr 03 202。源站描述仅说明研究目的是探究肝脏特异性 Sirt1 敲除小鼠的病理特征。关于样本采集部位、采集时间、实验条件、芯片平台的具体名称、RNA 提取方法、杂交流程等实验细节,源站未提供。主题标签中的 GPL19462 和 10090 分别指向芯片平台和小鼠物种,但平台的具体型号描述和样本来源信息在现有资料中未展开。

【适用场景】

该数据集适用于与肝脏特异性 Sirt1 敲除小鼠相关的肺部表达谱研究,尤其是需要从公共数据中获取小鼠肺组织微阵列数据的场景。由于本站分类为肿瘤 / 肺癌,它也可能被用于肺癌相关研究中的探索性分析,例如比较基因敲除模型与肿瘤发生过程中肺部基因表达变化的异同。此外,该数据集可用于方法学验证、表达谱数据读取流程测试,以及作为二次分析的输入数据。但需要注意,源站描述仅提及探究病理特征,未明确说明是否涉及肿瘤模型或肺癌表型,因此将其用于肿瘤机制推断时应保持谨慎。

【使用方法】

使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE326924_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,读取前需按 GZIP 格式解压或使用支持 GZIP 的读取工具。建议先在小样本上核对字段与编码,确认数据格式、样本标识和表达值编码无误后,再批量接入分析流程。由于文件为系列矩阵格式,通常包含样本信息和表达矩阵,但具体字段需以实际文件为准。源站未提供配套的分析脚本、标准化方法或注释文件,因此后续分析需根据通用微阵列数据处理流程自行设计。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI GEO,具有公共数据库的通用质量保障背景,但源站未提供样本量、重复数、质控指标、标准化方法或批次信息。数据仅包含 1 个文件,可能限制了对原始数据、补充文件和平台注释的获取。发布时间为 Apr 03 202,年份信息不完整,可能影响对数据时效性的判断。此外,源站描述非常简短,仅说明研究目的,未提供任何结论性发现或验证实验信息。因此,该数据集在解释生物学意义时存在信息不足的限制,使用者应结合其他公共数据和实验验证进行综合判断。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Yiwei,CAO,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用方式、许可协议、使用限制或版权声明,源站未提供。使用者在发表相关研究时,应遵循 NCBI GEO 的通用引用规范,并直接查阅源站页面获取最新的引用要求和许可信息。由于源站未提供具体许可条款,无法确认是否允许商业使用或再分发,建议在使用前自行核实。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE326924

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

探讨肝脏特异性Sirt1敲除小鼠的病理学。具体而言,肝脏特异性Sirt1敲除小鼠在三个月内出现高血糖。当小鼠年龄延长至一年时,与野生型相比,小鼠表现出惊人的更高的肺部肿瘤易感性,我们探索了该症状的潜在机制。

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