脉冲电场消融重编程肿瘤免疫并刺激非小细胞肺癌三级淋巴结构生发中心形成

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE325414

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数据说明

目的：这项治疗与切除临床研究评估了一种特殊形式的脉冲电场（PEF）消融在早期非小细胞肺癌（NSCLC）中调节抗肿瘤免疫的潜力。三级淋巴结构（TLS）是淋巴聚集物，能将免疫细胞招募到肿瘤微环境（TME）中，并作为免疫生成区域发挥作用。在大多数癌症中，具有生发中心（GC）的TLS具有强大的预后价值，并能促进肿瘤控制和对免疫治疗的反应，但目前尚无市售疗法能诱导其形成。Aliya系统是一种专有的电外科技术，可向组织传递微秒级电脉冲，在保持基质结构的同时实现肿瘤清除。患者与方法：治疗组患者在诊断性活检后立即接受消融，对照组仅接受活检。本文报告了探索性终点，即对两组患者采集的血液和肿瘤样本中的免疫调节进行检测。结果：组织病理学评估显示，切除的肿瘤中存在具有GC的TLS。

组织细胞因子评估和单细胞RNA测序显示，消融肿瘤与消融前活检相比，能够招募和组织TLS相关淋巴细胞的细胞因子（包括CXCL13）上调，且GC相关免疫细胞群（包括类别转换记忆B细胞和浆细胞）显著增加。消融组患者含有伴GC的TLS的肿瘤比例更高（47%），而对照组为24%。消融组患者表现出增强的全身免疫，血清HMGB1和循环细胞毒性T细胞增加。结论：这种特殊的PEF可能协调多种同时发生的变化，促进免疫活性更强的TME，并代表了一种改善NSCLC患者免疫治疗方案反应的新方法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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