肺癌中细胞毒性CD39+肿瘤相关NK细胞对NKG2A阻断的响应(10x Xenium)

源站描述显示,研究利用配对的单核RNA和ATAC测序解析非小细胞肺癌中肿瘤浸润NK细胞的转录与表观遗传景观,鉴定出以ITGAE(CD103)和ITGA1(CD49a)为标志的两个肿瘤相关NK细胞亚群,并揭示从GZMK+ NK细胞向ENTPD1+(CD39+)效应状态的炎症驱动转变

geo
浏览 5
基因组分类OtherGPL337629606
GSE319755: Cytotoxic CD39+ tumor-associated NK cells respond to NKG2A blockade in lung cancer (10x Xenium)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

肺癌中细胞毒性CD39+肿瘤相关NK细胞对NKG2A阻断的响应(10x Xenium)

Cytotoxic CD39+ tumor-associated NK cells respond to NKG2A blockade in lung cancer (10x Xenium)

该数据集来自NCBI,标题为肺癌中细胞毒性CD39+肿瘤相关NK细胞对NKG2A阻断的响应(10x Xenium),包含1个文件,样例为GSE319755_series_matrix.txt.gz。源站描述显示,研究利用配对的单核RNA和ATAC测序解析非小细胞肺癌中肿瘤浸润NK细胞的转录与表观遗传景观,鉴定出以ITGAE(CD103)和ITGA1(CD49a)为标志的两个肿瘤相关NK细胞亚群,并揭示从GZMK+ NK细胞向ENTPD1+(CD39+)效应状态的炎症驱动转变。数据可用于探索NK细胞分化、功能状态及免疫治疗响应机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):自然杀伤(NK)细胞靶向免疫疗法正在兴起,但肿瘤浸润NK细胞的分化与功能状态仍知之甚少。我们利用配对的单核RNA和ATAC测序对非小细胞肺癌(NSCLC)患者样本进行分析,解析了肿瘤内NK细胞的转录和表观遗传景观。我们鉴定出两个以ITGAE(CD103)和ITGA1(CD49a)表达为标志的肿瘤相关NK(taNK)细胞亚群,它们表现出组织驻留和功能障碍特征,同时保留细胞毒性功能。轨迹和调控子分析揭示了从早期颗粒酶K(GZMK)+ NK细胞向以干扰素刺激基因(ISG)程序为特征的ENTPD1+(CD39+)效应状态的炎症驱动转变。功能分析确定CD39+ taNK细胞是主要的细胞毒性NK细胞群体,具有优越的

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Other、GPL33762、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319755

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 02 202,引用时请注意版本时效。

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319755

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

自然杀伤(NK)细胞靶向免疫疗法正在兴起,但肿瘤浸润NK细胞的分化及功能状态仍知之甚少。我们利用非小细胞肺癌(NSCLC)患者样本的配对单核RNA和ATAC测序,解析了肿瘤内NK细胞的转录和表观遗传景观。我们鉴定出两个肿瘤相关NK(taNK)细胞亚群,分别以ITGAE(CD103)和ITGA1(CD49a)表达为标志,它们表现出组织驻留和功能障碍的特征,同时保留细胞毒性功能。轨迹和调控子分析揭示了一种炎症驱动的转变,从早期颗粒酶K(GZMK)+ NK细胞向以干扰素刺激基因(ISG)程序为特征的ENTPD1+(CD39+)效应状态过渡。功能分析确定CD39+ taNK细胞是主要的细胞毒性NK细胞群体,具有优越的杀伤能力,且该能力可被NKG2A阻断进一步增强。本研究为NSCLC中NK细胞分化提供了机制性见解,并确立CD39+ taNK细胞作为免疫治疗的可靶向效应群体。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。