CD47 促进 MAPK 与上皮间质转化分子程序驱动非小细胞肺癌促转移表型
该数据集来自 NCBI GEO,包含 CD47 野生型与敲除的非小细胞肺癌细胞的转录组测序数据,用于分析 CD47 内在信号驱动的细胞与分子过程

基本信息
资源简介
CD47 促进 MAPK 与上皮间质转化分子程序驱动非小细胞肺癌促转移表型
CD47 promotes MAPK and epithelial-to-mesenchymal transition molecular programs to drive pro-metastatic phenotypes in non-small cell lung cancer
该数据集来自 NCBI GEO,包含 CD47 野生型与敲除的非小细胞肺癌细胞的转录组测序数据,用于分析 CD47 内在信号驱动的细胞与分子过程。研究通过表达谱分析发现 CD47 调控富集于 MAPK 信号和上皮间质转化(EMT)特征的基因,并在大型 NSCLC 细胞系和肿瘤组织队列中观察到 CD47 与 MAPK/EMT 表达特征的正相关。数据可用于探索 CD47 在 NSCLC 中超越免疫逃逸的促肿瘤功能及转移相关分子机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 17 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):CD47 最广为人知的功能是参与肿瘤免疫逃逸;然而,在多种细胞模型中的研究表明,它还具有细胞自主的、促进肿瘤的功能,这些功能具有细胞类型和背景特异性。受 CD47 的预后和治疗意义以及对其在非小细胞肺癌(NSCLC)中超越免疫逃逸的作用了解有限的启发,我们试图定义 NSCLC 中由内在 CD47 信号驱动的细胞和分子过程。对 CD47 野生型和敲除 NSCLC 细胞的转录组分析表明,它调控的基因富集于 MAPK 信号和上皮间质转化(EMT)特征。在大型 NSCLC 细胞系和肿瘤组织队列中,CD47 与 MAPK/EMT 表达特征之间也明显存在显著正相关。功能研究表明,CD47 不调控细胞增殖
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319705
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 22 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
CD47最为人所知的是其在肿瘤免疫逃逸中的作用;然而,多种细胞模型的研究表明,它还具有细胞自主的、促进肿瘤的功能,这些功能具有细胞类型和情境特异性。鉴于CD47的预后和治疗意义,以及在非小细胞肺癌(NSCLC)中对其超越免疫逃逸作用的认识有限,我们旨在明确NSCLC中由内在CD47信号驱动的细胞和分子过程。对CD47野生型和敲除NSCLC细胞的转录组分析显示,其调控的基因富集于MAPK信号传导和上皮-间质转化(EMT)特征。在大型NSCLC细胞系和肿瘤组织队列中,CD47与MAPK/EMT表达特征之间也存在显著的正相关。功能研究表明,CD47并不像在其他癌症类型中那样调控NSCLC细胞的增殖。相反,CD47通过ERK和EMT轴调控细胞黏附和迁移,验证了我们的转录组学发现。
此外,CD47功能缺失显著削弱了NSCLC细胞在体内的转移能力,证明了肺癌细胞中细胞内在CD47信号传导的生理相关性。我们的数据揭示了CD47通过ERK传递信号以促进NSCLC中EMT表达程序及促转移表型的新作用。尽管需要更多机制性研究来进一步解析CD47-ERK-EMT信号通路,但我们的发现强化了CD47的治疗潜力,为进一步研究开发CD47阻断作为NSCLC多模式治疗提供了合理依据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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