GSE319378：ZEB1介导的circDennd1b抑制促进肺癌细胞迁移和侵袭

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319378

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数据说明

锌指E盒结合同源盒1（ZEB1）是与上皮-间质转化相关的重要转录因子，可促进肺癌进展和转移。肺癌进展可受微小RNA、长链非编码RNA和环状RNA（circRNA）等非编码RNA调控。然而，ZEB1转录调控circRNA表达的机制，以及ZEB1调控的circRNA如何与肺癌进展相关联，尚未完全明确。本研究旨在鉴定受ZEB1调控的circRNA，并阐明其在肺癌细胞中的功能。在ZEB1过表达的肺癌细胞（393P）中，我们通过RNA测序及CIRI-full分析筛选差异表达的circRNA。RNA测序鉴定出对照与ZEB1过表达肺癌细胞之间有25个差异表达的circRNA：11个circRNA上调，14个下调（倍数变化≥2，P≤0.05）。在这些circRNA中，我们选择了circDennd1b，即ZEB1过表达肺癌细胞中下调的circRNA。

为了敲低circDennd1b，我们使用了针对其反向剪接位点的shRNA，这导致了细胞迁移和侵袭的增加，类似于在过表达ZEB1的肺癌细胞中观察到的情况。我们目前正在研究circDennd1b在肺癌进展和转移中的作用。我们的研究表明，ZEB1调控的circRNA可能在肺癌的侵袭和进展中发挥关键作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。