GSE318135：β-Lapachone 拮抗 USP18 活性产生抗肿瘤效应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318135

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数据说明

去泛素化酶（DUB）泛素特异性蛋白酶18（USP18）是一个抗肿瘤靶点。需要USP18抑制剂。为满足这一未满足的需求，我们设计了一种具有酶活性的人重组USP18蛋白，用于高通量筛选。筛选发现β-拉帕醌是USP18-ISG15活性的抑制剂。独立使用β-拉帕醌处理小鼠和人肺癌细胞系，统计学显著降低了增殖并增加了凋亡。USP18表达的获得抵消了这些效应。β-拉帕醌处理统计学显著抑制了无胸腺小鼠中H1299人肺癌异种移植瘤的生长，以及移植了小鼠344SQ肺癌的同系小鼠中的生长。β-拉帕醌增加了活性氧（ROS），但抗肿瘤效应在ROS产生很少的浓度下即可发生。ROS清除剂处理未能挽救抗癌效应，表明参与了一种不依赖ROS的抗肿瘤机制。为确定这一点，使用了干扰素刺激反应元件（ISRE）报告基因试验。β-拉帕醌处理激活了该报告基因活性，符合USP18抑制剂的预期。

β-拉帕醌处理增加了整体ISG15结合。蛋白质组学分析和免疫沉淀实验揭示了已知和新的ISG15化蛋白。对有无USP18表达增益的 parental 肺癌细胞进行RNA测序，发现了β-拉帕醌处理后的差异表达基因和通路。综上所述，β-拉帕醌是一种新型USP18抑制剂和癌症生物学工具。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。