血管STING激活促进小细胞肺癌NK细胞抗肿瘤免疫 [CHIP-seq RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318080

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小细胞肺癌（SCLC）通常呈现“冷”肿瘤微环境，免疫浸润稀少。神经内分泌型SCLC细胞还会强烈抑制MHC-I表达，使其易受NK细胞介导的细胞毒性攻击。在此，我们证实神经内分泌型SCLC细胞对NK细胞介导的攻击敏感，然而对患者样本中SCLC免疫微环境的定量空间分析显示，效应免疫细胞（包括NK细胞）被排除在MHC-Ilow/neg的SCLC区域之外。为研究这一生物学现象，我们开发了微生理免疫肿瘤环境的动态单细胞RNA测序技术（DynaMITE-seq），并将结果与患者组织的空间转录组学整合，揭示微血管是限制NK细胞外渗/募集的主要检查点。我们证明，激活血管干扰素基因刺激因子（STING）信号可恢复NK细胞对神经内分泌型SCLC的浸润和杀伤，提示这是一种克服SCLC关键免疫屏障并为DLL3靶向CAR-NK细胞疗法的治疗应答做好铺垫的策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。