基于标志物筛选鉴定 ASCL1 和 POU2F1 为小细胞肺癌中 DLL3 表达的转录共调控因子 [ChIP-Seq]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为基于标志物筛选鉴定 ASCL1 和 POU2F1 为小细胞肺癌中 DLL3 表达的转录共调控因子 [ChIP-Seq]

geo
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基因组分类GPL301739606
GSE317996: Marker-based screens identify ASCL1 and POU2F1 as transcriptional coregulators of DLL3 expression in small cell lung cancer [ChIP-Seq]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-06

资源简介

基于标志物筛选鉴定 ASCL1 和 POU2F1 为小细胞肺癌中 DLL3 表达的转录共调控因子 [ChIP-Seq]

Marker-based screens identify ASCL1 and POU2F1 as transcriptional coregulators of DLL3 expression in small cell lung cancer [ChIP-Seq]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为基于标志物筛选鉴定 ASCL1 和 POU2F1 为小细胞肺癌中 DLL3 表达的转录共调控因子 [ChIP-Seq]。研究通过 CRISPR 筛选发现 POU2F1 是 SCLC 中 DLL3 表达的新型转录调控因子,并利用遗传和表观基因组学方法验证 POU2F1 与 ASCL1 可激活 DLL3 表达及神经内分泌谱系转录程序。数据包含 1 个文件,样例为 GSE317996_series_matrix.txt.gz,属于基因组结合/占据谱分析,适用于研究小细胞肺癌中 DLL3 的转录调控机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 29 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们进行了 CRISPR 筛选,以鉴定 POU2F1 是 SCLC 中 DLL3 表达的新型转录调控因子。我们使用遗传和表观基因组学方法验证了 POU2F1 和 ASCL1 可激活 DLL3 表达以及神经内分泌谱系转录程序。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL30173、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE317996

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 29 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们进行了CRISPR筛选,鉴定出POU2F1是SCLC中DLL3表达的一种新型转录调控因子。我们采用遗传学和表观基因组学方法验证了POU2F1和ASCL1可激活DLL3表达以及神经内分泌谱系转录程序。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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