葡萄糖缺乏及沉默转录因子ATF4和ATF6对人肺腺癌细胞系A549基因表达的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE317139

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤生长速度超过局部血管供应，导致氧气和营养物质短缺。为探究肺癌细胞如何应对低葡萄糖环境，我们利用RNA测序分析了葡萄糖饥饿的A549细胞中的转录变化。结果显示，与DNA复制和细胞周期相关的多条通路下调，代谢基因集受到调控。对葡萄糖剥夺最显著上调的转录反应是未折叠蛋白反应（UPR），该反应已被证明可促进对蛋白质毒性和内质网应激的适应。在多种非小细胞肺癌细胞系中，葡萄糖短缺强烈诱导了UPR的三条分支，表现为ATF4积累、XBP1 mRNA剪接和ATF6切割。ATF6和ATF4沉默实验表明，这些因子协同调控多个代谢基因以及与脂质合成、氨基酸合成和转运相关的通路。ATF4还额外调控了线粒体OXPHOS相关通路的转录诱导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。