AURKA/PHB2 信号驱动 KRAS G12C 突变 NSCLC 对 KRAS G12C 抑制剂的获得性耐药
该数据集来自 NCBI GEO,围绕 KRAS G12C 突变非小细胞肺癌(NSCLC)对 Sotorasib 的获得性耐药机制展开

基本信息
资源简介
AURKA/PHB2 信号驱动 KRAS G12C 突变 NSCLC 对 KRAS G12C 抑制剂的获得性耐药
AURKA/PHB2 signaling drives acquired resistance to KRAS G12C inhibitors in KRAS G12C -mutant NSCLC
该数据集来自 NCBI GEO,围绕 KRAS G12C 突变非小细胞肺癌(NSCLC)对 Sotorasib 的获得性耐药机制展开。研究以 H358 和 Calu-1 细胞系为对象,通过 qPCR、Western blot、MTS、克隆形成、Transwell 迁移、荧光素酶报告、FISH、分子对接和免疫共沉淀等实验,探讨 AURKA 在耐药中的作用及其与 PI3K/AKT 信号通路的关联。数据包含 1 个文件,主题为高通量测序表达谱,可用于研究 AURKA/PHB2 信号与 KRAS G12C 抑制剂耐药的相关机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 16 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):最初对靶向 KRAS G12C 突变的药物 Sotorasib 产生应答的非小细胞肺癌(NSCLC)患者最终会出现获得性耐药。然而,驱动这种获得性耐药的具体机制在很大程度上仍不清楚。本研究探讨了 AURKA 在介导 NSCLC 对 Sotorasib 耐药中的作用。使用 qPCR 和 Western blot 评估了 NSCLC 细胞系(H358 和 Calu-1)中 AURKA mRNA 和蛋白的表达水平。为进一步阐明 AURKA 在 Sotorasib 耐药细胞生物学改变中的作用及其与 PI3K/AKT 信号通路的关联,开展了一系列综合实验,包括 MTS、克隆形成、Transwell 迁移、荧光素酶报告基因实验、荧光原位杂交(FISH)、分子对接分析和免疫共沉淀。关键发现包括:(1) 长期 Sotorasib 治疗 l
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE316749
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 24 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
非小细胞肺癌(NSCLC)患者对靶向KRAS G12C突变的药物Sotorasib初始应答后,最终会产生获得性耐药。然而,驱动这种获得性耐药的机制在很大程度上仍不清楚。本研究探讨了AURKA在介导NSCLC对Sotorasib耐药中的作用。采用qPCR和Western blot评估了NSCLC细胞系(H358和Calu-1)中AURKA mRNA和蛋白的表达水平。为进一步阐明AURKA在Sotorasib耐药细胞生物学改变中的作用及其与PI3K/AKT信号通路的关联,进行了一系列综合实验,包括MTS、集落形成、Transwell迁移、荧光素酶报告基因检测、荧光原位杂交(FISH)、分子对接分析和免疫沉淀。
关键发现包括:(1) 长期Sotorasib治疗导致AURKA上调;(2) AURKA过表达诱导Calu-1和H358细胞对Sotorasib耐药,抑制凋亡并促进迁移潜能,而AURKA敲低则增加H358-SR和Calu-1-SR细胞对Sotorasib的敏感性,增强凋亡并抑制迁移能力;(3) 免疫沉淀和荧光素酶报告基因实验证实AURKA与PHB2之间存在物理相互作用,建立了一个维持恶性行为的正反馈环路,这可能解释了Sotorasib耐药细胞如何在KRAS通路被抑制的情况下存活;(4) AURKA稳定PHB2,激活PI3K/AKT通路,使癌细胞绕过KRAS阻断,从而恢复恶性行为。(5) AURKA抑制剂与Sotorasib联合使用可在体外和体内缓解获得性耐药。这些数据表明,NSCLC中对Sotorasib的耐药与涉及AURKA、PHB2和PI3K/AKT信号的正反馈环路相关。AURKA可能作为预测KRAS
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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