AURKA/PHB2 信号驱动 KRAS G12C 突变 NSCLC 对 KRAS G12C 抑制剂的获得性耐药

该数据集来自 NCBI GEO,围绕 KRAS G12C 突变非小细胞肺癌(NSCLC)对 Sotorasib 的获得性耐药机制展开

geo
浏览 5
时间序列分类GPL342849606
GSE316749: AURKA/PHB2 signaling drives acquired resistance to KRAS G12C inhibitors in KRAS G12C -mutant NSCLC

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

AURKA/PHB2 信号驱动 KRAS G12C 突变 NSCLC 对 KRAS G12C 抑制剂的获得性耐药

AURKA/PHB2 signaling drives acquired resistance to KRAS G12C inhibitors in KRAS G12C -mutant NSCLC

该数据集来自 NCBI GEO,围绕 KRAS G12C 突变非小细胞肺癌(NSCLC)对 Sotorasib 的获得性耐药机制展开。研究以 H358 和 Calu-1 细胞系为对象,通过 qPCR、Western blot、MTS、克隆形成、Transwell 迁移、荧光素酶报告、FISH、分子对接和免疫共沉淀等实验,探讨 AURKA 在耐药中的作用及其与 PI3K/AKT 信号通路的关联。数据包含 1 个文件,主题为高通量测序表达谱,可用于研究 AURKA/PHB2 信号与 KRAS G12C 抑制剂耐药的相关机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 16 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):最初对靶向 KRAS G12C 突变的药物 Sotorasib 产生应答的非小细胞肺癌(NSCLC)患者最终会出现获得性耐药。然而,驱动这种获得性耐药的具体机制在很大程度上仍不清楚。本研究探讨了 AURKA 在介导 NSCLC 对 Sotorasib 耐药中的作用。使用 qPCR 和 Western blot 评估了 NSCLC 细胞系(H358 和 Calu-1)中 AURKA mRNA 和蛋白的表达水平。为进一步阐明 AURKA 在 Sotorasib 耐药细胞生物学改变中的作用及其与 PI3K/AKT 信号通路的关联,开展了一系列综合实验,包括 MTS、克隆形成、Transwell 迁移、荧光素酶报告基因实验、荧光原位杂交(FISH)、分子对接分析和免疫共沉淀。关键发现包括:(1) 长期 Sotorasib 治疗 l

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE316749

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 24 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE316749

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

非小细胞肺癌(NSCLC)患者对靶向KRAS G12C突变的药物Sotorasib初始应答后,最终会产生获得性耐药。然而,驱动这种获得性耐药的机制在很大程度上仍不清楚。本研究探讨了AURKA在介导NSCLC对Sotorasib耐药中的作用。采用qPCR和Western blot评估了NSCLC细胞系(H358和Calu-1)中AURKA mRNA和蛋白的表达水平。为进一步阐明AURKA在Sotorasib耐药细胞生物学改变中的作用及其与PI3K/AKT信号通路的关联,进行了一系列综合实验,包括MTS、集落形成、Transwell迁移、荧光素酶报告基因检测、荧光原位杂交(FISH)、分子对接分析和免疫沉淀。

关键发现包括:(1) 长期Sotorasib治疗导致AURKA上调;(2) AURKA过表达诱导Calu-1和H358细胞对Sotorasib耐药,抑制凋亡并促进迁移潜能,而AURKA敲低则增加H358-SR和Calu-1-SR细胞对Sotorasib的敏感性,增强凋亡并抑制迁移能力;(3) 免疫沉淀和荧光素酶报告基因实验证实AURKA与PHB2之间存在物理相互作用,建立了一个维持恶性行为的正反馈环路,这可能解释了Sotorasib耐药细胞如何在KRAS通路被抑制的情况下存活;(4) AURKA稳定PHB2,激活PI3K/AKT通路,使癌细胞绕过KRAS阻断,从而恢复恶性行为。(5) AURKA抑制剂与Sotorasib联合使用可在体外和体内缓解获得性耐药。这些数据表明,NSCLC中对Sotorasib的耐药与涉及AURKA、PHB2和PI3K/AKT信号的正反馈环路相关。AURKA可能作为预测KRAS

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案