支原体感染通过转录组重编程驱动NSCLC的EGFR-TKI耐药

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE314455

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

表皮生长因子受体（EGFR）突变是非小细胞肺癌（NSCLC）的致癌驱动因素，但EGFR酪氨酸激酶抑制剂（TKI）耐药仍是重大挑战。本研究表明，支原体感染可维持ERK、AKT和NF-κB信号传导，损害受体内吞，并降低EGFR突变NSCLC细胞对奥希替尼的敏感性。抗生素介导清除支原体可部分恢复药物敏感性，从而确立感染与耐药之间的因果关系。转录组分析鉴定出支原体感染与耐药相关的汇聚通路，包括在蛋白质水平富集于受体内吞抑制和网格蛋白下调的基因集。联合抑制mTOR和LDHA可改善支原体阳性细胞的生长抑制。在临床上，支原体感染和较高的LDHA表达与接受EGFR-TKI治疗患者的总生存期较差相关。这些发现确立支原体感染是EGFR-TKI耐药的因果性非遗传因素，并支持一种结合抗生素清除与mTOR和LDHA抑制的分层治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。