BATTLE试验索拉非尼组最终疗效与生物标志物分析数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE31428

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的：确定BATTLE试验中索拉非尼单药治疗晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者的8周疾病控制率（DCR）。方法：既往接受过治疗的NSCLC患者同意接受基线活检，用于预先指定的生物标志物评估和生物标志物发现。索拉非尼以400 mg口服，每日两次，直至肿瘤进展或出现不可接受的毒性。按预先指定的生物标志物分析结局，并利用NSCLC细胞系和基线活检的高通量基因表达谱开发索拉非尼敏感性特征。结果：105例患者符合条件，98例患者可评估。中位年龄为62岁（范围34-81岁），51%的患者为男性，75%为既往/当前吸烟者，89%的ECOG体能状态为0-1。IV期NSCLC既往化疗的中位数为2次。中位随访时间为9.4个月（范围：1.3-32.2）。总体8周DCR为58.2%。与野生型肿瘤患者相比，EGFR突变患者的8周DCR显著更低（23.1% vs. 64.2%，P=0.0119），而K-RAS突变患者的8周DCR最高（67%）。

最常见报告的治疗相关不良事件包括手足综合征（59.6%）、疲劳（42.3%）、皮疹（40.4%）、腹泻（38.5%）和体重减轻（38.5%）。在细胞系中开发的索拉非尼敏感性特征与改善的结果相关。结论：野生型EGFR患者，包括那些具有K-RAS突变的患者，可能从索拉非尼中获益，而不是EGFR突变的患者。我们确定了一个与接受索拉非尼治疗的野生型EGFR患者改善结果相关的基因表达特征。BATTLE-2试验正在进行中，以验证这些结果。ClinicalTrials.gov编号，NCT00411671。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。